本学科主要研究方向为：（1)肿瘤相关病毒和重要性传播疾病病原基因工程疫苗研究；（2)基因工程疫苗载体研究；（3)肿瘤相关抗原和重要性传播疾病病原免疫信息学研究；（4)广州管圆线虫、弓形虫等重要病原生物的分子寄生虫学研究。内容涉及分子疫苗设计和免疫保护、免疫信息学、功能基因、免疫诊断和免疫病理机制研究及传病蚊媒的microRNAs鉴定及其基因调控功能研究。
本学科已建成了结构合理的学科团队，教授4人，副教授8人，博士7人，硕士6人。目前，承担着世界卫生组织、国家自然科学基金，浙江省自然科学基金医.学,全 在线提供www.lindalemus.com，浙江省卫生厅重点课题等，取得了一系列重要研究成果。先后完成25项课题研究，在国内外有影响的杂志上发表100余篇论著，多项研究成果获教育部科技进步奖、浙江省政府科技进步奖二等奖和三等奖、温州市科技进步二等奖和三等奖等各级科技奖励18项；并在此基础上，于2002年成立了分子病毒与免疫研究所，寄生虫病研究所；申请发明专利7项；数位本学科研究生分别在第24届国际乳头瘤病毒大会上获” Fogarty International Training Program award”奖。
仅2009-2011年，本学科获国家自然科学基金资助7项，浙江省自然科学基金资助5项，其它课题资助7项，获资助总经费300余万元；申请发明专利1项，进入实审阶段的发明专利1项；发表论文22篇，其中SCI收录7篇，影响因子（IF)总计达10分， 国内一级刊物发表论文10篇；进行国内外学术交流15人次，分别邀请美国国立卫生研究院（NIH)专家和澳大利亚昆士兰大学专家来温进行学术指导访问；培养研究生毕业11人。
