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  于吉人西医综合笔记—生物化学           ★★★ 【字体:
于吉人西医综合笔记—生物化学
作者:未知 文章来源:医学全在线 更新时间:2006-7-29


Chaper 5 脂代谢
类脂:固醇,酯,磷脂及糖酯
甘油三酯: 分解
一、甘油三酯的合成与分解
(一)分解,甘油三酯 甘油三酯脂肪E(关键E) 甘油+脂肪酸
该脂肪酶:激素敏感的脂肪酶,易受激素调节,如肾上腺素紧张


Chaper 6   生物氧化
有关能量的来源途径:(1)底物水平磷酸化,直接将代谢分子中的能量转移至ADP(GGDP),生成ATP(GDP),三步反应;(2)氧化磷酸化,提供能量更多.
一、氧化磷酸化:代谢物经氧化分解释放能量,从而偶联ADP磷酸化,产生ATP,电势能-化学能
1、呼吸链的排列顺序
2、两条呼吸链的组成
3、糖耦联磷酸化部位
4、P/0比值;消耗P和O的比值,即生成ATP摩尔数;NADH:P/0=3 FADH:P/0=2
5、氯化磷酸化的调节,ADP/ATP 下降时,ATP多,氯化磷酸化减强
二、ATP能量储存,转运的枢纽,GTP、UTP、CTP能量都来自ATP
磷酸肌酶可以作为主能化合物,是能量的一种储存形式,但不能直接供能,磷酸肌酸提供
磷酸烯醇式丙酮酸:乙酰磷酸,乙酰COA
DATP DGTP DUTP DCTP不能放能,故不是分解化合物


Chephter 7 氨基酸代谢
一、一般代谢:指AA的脱氨基作用。少量的脱羧可以生成有活性的物质。
1、方式:(1)谷aa脱H酶,(2)转氯基
转氨基作用(1)只渗入氨量的转移,不渗及脱落
(2)转氨酶的辅E是磷磷吡哆醛(胺)由VitB6转化而来。
因此,脱氨基作用多为联合脱氨基,方式有两种,(1)肝、肾、脑中L-谷aa
氧化脱氨基作用(2)心肌骨骼肌中是嘌呤核苷酸酸循环。
2、产物有a酮酸和NH3两种(1)a酮酸的代谢(1)再NH3化,生成相应aa
(2)转变为其它物质:糖和酮体,即分为生糖aa,生酮aa,生糖兼生酮aa,包含有
例:丙aa(生糖aa)联合脱氨丙酮酸丙酮激ECHCOCOA酮体(理论上可以生成)
(3)可以氯化分解供能,可以提供ATP
aa可以生成脂肪和糖
糖可以部分转化为aa,除外必须aa以食物供给,亮亮颉色,苯蛋赖苏,食物的营养价值取决于必需的种量和数量。
(2)NH3的代谢
1、来源(1)aa的脱氨基(主要来源)(2)从肠道而来NH3+H+ →NM4++OH-→吸收入血氨(3)肾小管上皮细胞:谷氨酰胺酶(肝硬化的血氨病人,洗肠时用酸性物质)
2、运输:(1)谷氨酰胺的形式:谷a+MH3→谷氨酰胺→肾 、矸脏
(2)葡萄糖丙aa循环 NH3+丙酮酸→丙氨酸→MH3+丙酮酸
3、尿素合成-鸟氨酸循环
(1)部位:肝脏线粒体
(2)2个N:1个N来源于NH3,另一个N来源于天冬氨酸
(3)3个产物:瓜aa鸟aa不是组成pr的aa
二、个别aa代谢,
(一)脱羧作用:谷aa CO2一氨基丁酸 色
(二)一碳单位:1、概念:某些aa在分解代谢中可以产生含有一个碳原子的基因,
2、CO2不是一碳单位,碳单位载体是四氢叶酸
3、一碳单位的来源:丝色组甘(施舍一根竹竿)参加四清运动
4、一碳单位可以相互转变
5、作用:嘌吟,嘧啶的合成原料,故一碳单位是氨基酸和核酸代谢联系的枢纽。
三大物质代谢的枢纽是:CH3COTCOA,G6P是糖代谢合成,分解,磷酸糖途径,糖异生不同转化方式的联系枢纽。
(三)含硫aa的代谢
1、半胱aa→PAPS:机体内SO42-的供体
2、蛋aa在腺苷转移作用E下→SAM(S-腺苷蛋AA) →活性甲基的供体
(四)芳香族aa
苯丙氨酸缺乏引起苯酮的尿症


Chapter 8 核苷酸代谢 合成为重点
1、不是营养物质,无营养核酸之说,不要看过程,记住重要的点
一、分类
从头
合成
嘧啶核酸 补救
分解
核糖粒甘酸
核甘酸
脱氯糖甘酸
AMP(GMP)→DAMP,ADP→DADP, ATP→DATP
从核糖甘的转变为脱氯核甘的是在二磷的水平上进行的,抗代谢物是谁的类似物?它们抗代谢的生化机制是什么?
嘌吟核苷酸代谢的分解产物是尿酸(沉淀在关节,它一沉淀积便提供损伤关节引起痛症,治疗药物为别嘌吟醇,它能抑制黄嘌吟氧化酶的活性从而使尿酸生成减少)。
(二)嘧啶核甘酸的代谢产物:β-丙氨酸,由胞嘧啶分解生成的。(抗代谢物易出大题,抗代谢的代谢机理是什么?)


Chapter 9 DNA的生物合成
一、DNA的复制:
(一)过程:1、需要的酶:解链酶
2、单链DNA结合Pr
3、引物酶合成引物RNA,故是DNA指导的RNA聚合E
4、DNA聚合酶 5、RNA酶/核糖核酸E,水解掉RNA
6、DNA连接酶,连接起来
考点:1、酶作用的顺序,2、因子,E参与了DNA的复制
(二)特点:(1)半保留复制(2)合成方向5端→3端(3)模板DNA(4)主要E是DNA聚合酶,(5)什么依赖(指导)的XXE(6)原料:DNTP(7)产物DNA (8)DNA合成都需要引物,RNA合成都不需要引物。引物是为了在糖位原子上提供一个羟基,(8)衰老的端区学说合成一点,减少一点(不衰老CELL存在端粒酶,故DNA链不缩短,故cell不死亡),端粒酶(1)组成:蛋白质+RNA(2)本质:以RNA为模板合成DNA,故是递转录过程(3)存在于增殖旺盛的组织里面,如肿瘤CELL,骨髓干细胞分化较低,端区是一个重复序列。
二、逆转录过程,以MRNA为模板,在递转录酶的作用下,利于DNTP为原料,根据碱基互补配对的原则,合成DNA的过程。
逆转录E是:1、RNA 指导的DNA聚合酶
2、合成的互补链DNA称为CDNA
3、CDNA文库,包含了MRNA的信息:
4、作用:临床上应用
5、合成CDNA意义:(1)MRNA易于衰老,半衰期短(2)空气中有解离MRNA的E
三、DNAM提供修复,切除一修复
1、催化DNA合成复制的酶是:DNA-polI、II、III
2、损伤修复的酶主要是DNA聚合酶I
线粒体中 DNA的复制的酶:DNA-polr
四、原核、真粒生物DNA复制的不同点


chapter 10 RNA合成
一、合成以原核生物为例,加工则是指真核生物
1、RNA聚合物附着到启动子上,需要很多转录固子。
2、转录为不对称转录,合成方向5端-3端,3、模板DNA
4、主要E是DNA指导的RN聚合E,5、原料NTP,6、产物:RNA
7、不需要引物
考点:RNA聚合E的组成,复制转录的区别
真核生物的DNA序列特点
二、MRNA的加工
1、加工方式加帽,加尾,转录后加上去
2、剪接过程,两次剪接过程,把内合子去掉,把外显子连接起来。
例:内合子通过剪接过程去掉
3、编辑作用:在RNA序列中插入或删除核甘酸,第二次遗传信息修正(TRNA涉及到碱基的修饰)。


Chapter 11 蛋白质合成
一、三种RNA的作用
1、MRNA作为模板,从AUG开始每3个核甘酸组成一个密码,密码子特点:(1)起始密码子,AUG,代表了翻译起始,又代表蛋aa,开放读码框架。
UAA、UAG、UGA为三个终止密码子,不代表任何aa,(2)连续性:插入或缺失造成“读码框架移位”(3)简并性:密码子上第三个碱基致变不影响aa的翻译。Aa:UUG、UUA、UUC、UUU,(4)通用性:从原核生物到人类同一套密码(5)摆动性,常由于密码子第三位碱基对反密码子第一位碱基,最常见的是黄嘌吟I。
2、TRNA: 氨酸酰-tRNA合成E
密码子是GGC,那么识别它的TRNA上的反密码子GCC(方向)摇摆配对:反密码子第一位的碱基和密码子第三位碱基配对时常不是严格按照碱基外酸对原则,I(次黄嘌呤)
3、RRNA作用:作用与PR结合在一 起,为PR合成提供场所。(了解)
二、合成需要注意点:(原核生物与真核生物PR合成的异同点)
1、模板:MRNA 2、方向:N断→C端 3、主要的酶和参与因子,起始固子,延长固子,终止因子,原核与真核区别,主要的E为转肽E,位于大亚基的间立上。催化肽键形成,催化3’5’-磷酸二酯键的形成,DNA(RNA)聚合酶未催化4、原料:aa 5、产物:多肽链6、由GTP提供能量,耗能的过错
三、Pr合成后的加工(一)高级结构:
1、亚基的聚合:白红蛋白两个亚基αβ-亚基以非共价键聚合
2、辅基的连接:与辅基结合后才有语性。
一级结构:(1)去掉N端蛋AA,(2)个别aa的修饰作用:碱基修饰,羟脯AA,羟赖AA (3)水解修饰作用:水解一个肽段才有活性。
例:哪些属于PR加工过程,(如亚基聚合,aa修饰作用)
四、分泌pr 核蛋白体,常依于粗面内质网上,合成之后,把信号肽水解掉后,成熟到高尔基体分泌出去。
五、PR合成的干扰和抑制
干扰素对病毒作用机制:课本P290,两方向的作用
考大题:(1)比较DNA复制,RNA合成,PR合成的异同点
(2)原核,单核生物合成PR的异同点


chapter 12 基因表达的调控
一、基因表达:一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因
即基因组,基因表达就是基因转录和翻译的过程,并非所有基因
表达都产生PR,rRNA和tRNA合成DNA也是基因表达,剪接体表达
例r、多肽键、rRNA属于,糖脂合成不是
1、特点:(1)时间特异性:指基因表达严格按特定的时间顺序开启或关闭。例甲胎蛋白基因在胎儿表达,出生后关闭,又称阶段特异性。(2)空间特异性,指多细胞生物,同一基因在不同的组织器官表达多少不同,或因一生长阶段,不同的基历表达产物在不同组织器官分布也不相同,也称组织特异性,如肾脏合成EPO,肝脏合成酮体的特异性
各器官的MRNA,CDNA都不同
2、表达方式:(1)组成性表达,某个基因的表达对其生命很重要,持续表达,很少受环境影响,称为管家基因。特点:(1)细胞生命注动所必需要(2)很少受外界环境影响而改变,波动很小(3)几乎在所有的组织细胞内或发育阶段均表达。(2)与管家基因相对的基因,奢侈基因,(1)不是必需(2)受外界环境影响很大,表达增高时,称为可诱导的,反之,是不可遏制的.(3)不是所有的细胞或阶段均表达,决定了不同器官组织的特异性(诱导Gene 遏制 Gene)
考点:(1)什么是时间特异性,空间特异性,(2)管家基因的描述
二、基因表达调控
(一)基本原理:1、基本要素:(1)特异性DNA的调节序列,指对基因的转录具有调节作用的一类特殊DNA序列,自身并不转录
人为改变这一致序列,会使整条DNA序列功能丧失,常为转录因子的锚点,即结合依点。
顺式作用元件:在直核生物内,对自身基因有调节作用的DNA序列,对基因的调控至关重要,(2)调节蛋白/转录因子:指对Gene 转录有调节作用的一类特殊蛋白质.搭桥R与PR结合
转录因子的进一步定义:通过PR与基因作用或PR相互作用对转录进行调节的特殊蛋白质。
(3)通过对RNA聚合酶的活性进行调节来体现顺式作用与转录因子的作用TFIID与TATA-box结合。
DNA调节序列即不转录也不翻译,内合子转录但不翻译,外显子既转录翻译
只有肝脏才有与无件结合的RNA的聚合酶
转录因子是基因表达多样性的源泉,或者说,它在基因表达中主导作用.
反式作用因子-机体内大多数以反式作用因子调节为主要方式
三、原核生物中基因转录特点:(1)决定RNA聚合酶识别特异的是θ因子;(2)操纵子来实现基因转录
操纵子-几个功能相同的基因串联成族,受同一调节机制调节的结构;多顺反子-包括2个(含以上)编码
(3)以负性调节点占主导,以乳糖操纵子为例
阻遏Pr和操纵序列结合阻遏RNA聚合E的结合,称为负性调节.
少量的 半乳糖+阻遏Pr→阻遏Pr变构脱落→转录开始
考点:(1)阻遇PR结合操纵序列,RNA聚合和启动序列结合
(2)原核生物转录出的是多顺反子(3)以负性调节为主导。
大题:以乳糖操作子为例,说明原核生物基因转录原理
四、真核生物中的基因转录:
(1)基因组织构的特点:庞大(2)为单顺反子结构(3)重复序列,一般序列在基因组织多次重复(4)基因的不连续性。
(2)表达调控制特点:(1)RNA聚合E不同(2)基因转录必须有染色质活化
a、凡是活化的染色质对核酸酶高度敏感,b、DNA拓补结构变化,c、DNA碱基修饰变化,(3)转录活跃的甲基化水平低,不转录的甲基化水平高(4)组pr修饰增加,尤其是乙酰化。
(3)以正性调节占为主导。(4)转录和翻译是分隔进行的。(5)转录后修饰加工。
考题:原、真核生物基因转录的异同点
五、基因转录激语的调节:
(一)顺式作用元件;启动子+增强子+沉默子
启动子的特点:(1)转录所必需(2)常低于基因的5’侧翼(3)近距离作用(4)右方向性
增强子的特点:(1)使用转录活性增高,但不是转录必需(2)可低于基因的上中下游(3)可近可远的调节(4)对基因转无方向性(5)作用必经启动子起作用(6)具有组织器官特异性(与之结合的转录固子)
3、沉默子的特点与增强子增强相似,但它使转录活性下降

 

Chapter13 基因旧重组与基因工程
一、基因旧重组技术
(一)概念
(二)方法:1、化学合成法,2、CDNA 3、基因组 4、PCR最快捷方便获得目的基因
(1)PCR原理,(2)PCR一个循环由变性-退火-延伸组成,(3)Tag酶耐热
(4)退火温度取决于引物的Tm值
大题:PCR原理及在医学中的应用
(三)载体:质粒DNA,病毒DNA(腺病毒递转录病毒),噬菌体DNA人工载体,真核生物不能作用于载体(比如昆虫)
(四)DNA重组里需要的酶要记
1、限制性的内切酶:是有识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶
它识别的是双链DNA(2)需要特别序识别(3)核酸内切酶
2、识别序列特点:回文结构
原核生物里来的
通过DNA连接酶连接起来的,(DNA复制损伤修复)
质粒-倒入-大肠杆菌里称为转化,质粒倒入真核细胞称转染
质粒-倒入缩主C里称为感染
倒入后的筛选通过分子杂交实验(最直接的方法)
DNA重组技术的基本原理、过程、医学中的应用
细胞信息传递
通过肌PR的传导途径(通路)
肌PR的特点
肾上腺毒调节糖原的通路
AMP激火PKA CGMP激活PKG
Ca2+ 与钙调PR结合对C进行调节,以下酶类要看
细胞核受体的特点:
1、配体常是脂溶性的 2、本身就是一个转录因子
血液的生物化学
一、非蛋白氮:非PR类氮化合物,主要有尿素、肌酸、肝酐、尿酸、胆红素和NH3,它们中的氮总称为非蛋白氮(NPN)
其中白尿素(BUN)约占NPN的1/2,最为重要,
RBC代谢的特点,2、2、3一二磷的甘油酸旁路的定义、生理意义?3、血红素的生
成:(1)原料(2)合成的关键E:NADH合酶
4、肝的生物转化作用:(1)生物转化定义、类型(氧化还原水解、还原最重要)
氧化酶的概念和组成特点(在氧化还原反中)(3)生物转化中最重要的结反应是葡萄糖醛酸结合。
葡萄糖醛酸的供体是:UDPGA
5、初/次级胆汁酸的定义,由胆固醇和7-2羟化酶转变而形成胆汁酸。
6、胆汁酸的功能:
7、胆色素代谢中胆红素重点:(1)直接胆红素与间接胆红素的区别及定义
(2)肝内与胆红素运输相关的蛋白:Y蛋白、Z蛋白(缺少导致新生儿黄疸)
8、各种黄疸的区别?Vit不用看
癌在因,抑癌基因与生长因子
1、癌基因的特点:(1)存在于正常C(2)对C的生长和分化有调节作用,(3)产物遍布全身各个角落(4)反常定表达会导致细胞癌变
2、抑癌基因:(1)存在于正常C(2)对C的生长、分化、也有调节作用(3)缺失会导致细胞癌变(4)在肿瘤C里把此基因倒入也抑制肿瘤生长,这种基因叫做抑癌基因
3、生长因子:对C生长和分化具有调节作用的一类小肽物质
4、基因的定义和程序?

注意:生化笔记不全,希望大家能够帮补上。欢迎到论坛交流

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