《琼瑶神书》,约成书于元末明初,作者为兼通针术的道人。经考证,题曰“琼瑶神书”之书至少有三种。其一,《琼瑶神书》三卷(今佚);其二,明刊《琼瑶发明神书》三卷(又作“琼瑶真人针经”),此乃后人伪作,与前书内容迥然不同;其三,清刊《琼瑶神书》四卷(又作“琼瑶神书大成”)。此本真伪参半,其卷三末补有两部与原书内容完全无关的医书,别卷也间有后人增补之文。