除了用基因作探针直接检测基因内的核苷酸变化引起的RFLP外，还有两种途径：一是用基因作探针，检测该基因两侧顺序中核苷酸变化引起的RFLP，确定这些RFLP与遗传病之间有无连锁关系。另一种是用克隆的专一DNA顺序作探针，检测基因两侧顺序DNA的RFLP与遗传病的连锁关系。迄今用上述三种方法已查明近30种遗传病可通过RFLP来检测。表23-5、6、7为部位举例。
表23-5 用基因作探针检测基因内的结构变化来直接分析遗传病
| 遗传病 | 探针 | 年代 |
| 抗凝血酶Ⅲ缺乏症 | 抗凝血酶Ⅲ基因 | 1983 |
| α1抗胰蛋白酶缺乏症 | 合成的寡核苷酸 | 1983 |
| 动脉粥样硬化症 | 载脂蛋白A-基因 | 1983 |
| 糖尿病 | 胰岛素基因 | 1983 |
| Ehlers-Danlos综合症 | α（1)胶原蛋白基因 | 1983 |
| 生长激素缺乏症 | 生长激素基因 | 1981 |
| 乙型血友病 | 凝血因子ⅠⅩ基因 | 1983 |
| 遗传性胎儿血红蛋白持存症 | β珠蛋白基因 | 1979，1983 |
| HPRT缺乏症 | HPRT基因 | 1983 |
| 自毁容貌综合征 | HPRT基因 | 1983 |
| 成骨不全 | 原α1（1)胶原蛋白基因 | 1983 |
| 视网膜母细胞瘤 | Rb基因 | 1983 |
| 镰形细胞贫血 | 合成的寡核苷酸 | 1983 |
| 地中海贫血 | β珠蛋白基因 | 1981 |
| α和β珠蛋白基因 | 1978，1980 | |
| 甲型血友病 | 凝血因子Ⅷ基因 | 1985 |
表23-6 用克隆的DNA片段作探针检测连锁的RFIP间接分析遗传病
|
遗 传 病 |
探 针 |
探针与疾病基因座位间距离（cm)* |
年 代 |
| 脆性X综合征 | PN1，VK21，U6-2 |
＜5 |
1989 |
| 慢性进行性舞蹈病 | G8 |
＜10 |
1983 |
| Menkes钢发症 | L1，28 |
16 |
1983 |
| 肌营养不良 | |||
| 良性假肥大型 | XJ和per+87系列 |
?/FONT> |
1983 |
| 假肥大型 | XJ和per+87系列 |
?/FONT> |
1986 |
| 强直性肌营养不良 | 补体C3基因 |
7 |
1983 |
| 类固醇-硫酸酯酶-X链锁甲癣 | λRC8 |
25 |
1983 |
| 视网膜劈裂症（Retinoschisis) | λRC8 |
15 |
1983 |
表23-7 用基因作探针检测紧密连锁的RFLP间接分析遗传病
| 遗传病 | 基因探针 | 年代 |
| 糖尿病（Ⅱ型) | 胰岛素基因 | 1981，1983 |
| 生长激素缺乏症（Ⅰ型) | 生长激素基因 | 1982 |
| 高甘油三酯血症 | 载脂蛋白A-1基因 | 1983 |
| 苯酮尿症 | 苯丙氨酸羟化酶基因 | 1983 |
除了遗传病与RFLP之间的关系的资料，还发现人体癌基因Ha-ras的Bam HI片段的长度可在6.75～8.7kb之间变动。这种RFLP是由于Ha –ras基因有一段可变串联重复顺序（vari-able tandem replication,VTR)。重复顺序长28bp、重复次数可以不同，所以造成BamHⅠ片段的长度变化。图23-9中左图箭头是某种酶的切点，黑框代表可变串联重复顺序。右图代表某种酶切割后，不同个体显示的电泳图谱。1/1、2/2、3/3代表1、2、3等位基因的纯合子；1/2、1/2、2/3代表三种可能的杂合子，由于重复顺序数目不同改变了该酶的切点位置，因而形成不同长度的DNA片段。除Ha-ras癌基因外，成人多囊肾（adult polycystic kidney)基因旁也出现VTR，现已用它作携带者及产前诊断。
图23-9 可变串联重复顺序（VTR)示意图
