重要的营养素与药物的相互作用包括饮食对药物溶解性的影响，营养缺乏症时药物动力学改变，药物诱导的食欲改变及药物诱导的营养不良(参见第301节)。
个别的食物成分可以增强，阻止或减低药物的吸收。例如，酪胺是乳酪的一种成分，是强烈的血管收缩剂。某些服用单胺氧化酶抑制剂的患者吃乳酪后，酪胺可以导致血压升高。高蛋白质饮食可以通过刺激细胞色素P-450的诱导而提高药物代谢的速率。能改变肠道菌丛的饮食可以显著地影响某些药物的整体代谢。
营养素缺乏，如钙，镁和锌缺乏能损害药物的代谢。能量和蛋白质缺乏会使组织的酶水平降低，并因为吸收减少及肝功能障碍而损害药物的效应。由于胃肠道变化而引起的吸收不良也会影响药物的效应。维生素C缺乏可与药物代谢酶的活性有关。老年人常常发生不良药物反应，这可能与他们维生素C状态常常过低有关。
许多药物都能影响食欲，吸收及组织代谢(表1-11)。
某些药物影响矿物质的代谢。利尿剂，特别是噻嗪类和皮质类固醇药物引起钾缺失时，能使洋地黄诱发心律失常的危险性增加。钾缺失也可因经常服用泻药引起。使用氢化可的松，脱氧皮质酮和醛固酮时，可出现明显的水钠潴留，至少短期内如此；而使用强的松，氢化强的松和较新的类固醇药物时，水钠的潴留则少得多。这种情况在使用雌激素-孕激素口服避孕药和保泰松时也会发生。其他作用包括硫酰脲，保泰松，钴和锂可降低甲状腺对碘的吸收或释放；口服避孕药可降低血浆锌的含量，提高铜的含量；长期使用肾上腺类固醇可引起骨质疏松症。
许多维生素的代谢可受到药物的影响。乙醇能损害硫胺素的吸收，而异烟肼则是一种尼克酸和吡哆醇的拮抗剂。乙醇和口服避孕药能抑制叶酸的吸收。服用苯妥英，苯巴比妥，去氧苯巴比妥或吩噻嗪进行长期抗惊厥的大多数病人血清及红细胞叶酸含量下降，偶尔也能引起巨幼红细胞性贫血，可能是因为肝脏微粒体药物代谢酶受到了影响。补充叶酸会干扰抗惊厥剂的作用，但补充酵母片似乎可以提高叶酸水平而无此作用。抗惊厥剂诱导的维生素D缺乏症已得到公认。有报道说，使用氨基水杨酸，缓慢释放的碘化钾，秋水仙素，三氟吡啦嗪，乙醇和口服避孕药能引起维生素B12吸收不良。
口服避孕药的妇女主诉抑郁症通常与孕激素含量增高有关。有人认为其机制是色氨酸吡咯酶被诱导后，导致在消耗5-羟色胺神经递质形成的情况下利用吡哆醇合成尼克酸。这些患者通常服用吡哆醇25mg每日3次有效。
营养素的代谢也会受到其他营养素的影响。例如，膳食中的许多物质可减低或促进非血红素铁的吸收(参见第127节)。
