肝动脉先天性异常很常见。主要变异包括左右肝动脉换位，多出现一根左肝动脉或右肝动脉，或者肝动脉由肠系膜上动脉发出。这些变异通常没有临床意义，但对外科手术和血管造影很重要。
肝动脉闭塞常由血栓，栓塞，腹部外伤或手术结扎引起。血管闭塞可引起肝缺血性梗死，但后果不定，因为肝血管床和侧支循环范围有个体差异。
肝动脉内血栓常由肝动脉炎引起。大约60%的多发性结节性动脉炎患者累及肝动脉及其分支，且15%的患者发生血栓性肝动脉闭塞并导致肝细胞梗死。创伤，肝移植，经肝动脉灌注抗癌药物也可引起血栓性肝动脉闭塞。肝细胞梗死还可发生于无血栓形成的休克，充血性心力衰竭和妊娠毒血症。
肝动脉瘤并不少见，常为囊性和多发性。可表现为腹痛，黄疸和胆道出血。肝动脉瘤增大到一定程度可引起肝外机械性胆道梗阻，若不治疗，75%的肝动脉瘤可向胆总管，腹腔或邻近空腔脏器内破溃，死亡率很高。病变常继发于感染，动脉硬化，外伤和多发性结节性动脉炎。
增强CT和血管造影是诊断肝动脉瘤最佳的手段。一旦确诊，应立即行动脉导管栓塞术，如这种治疗失败，则需行肝动脉结扎术。
