1．腰穿后头痛
腰穿后头痛是最常见的一种并发症，发生机制是由于腰穿放出脑脊液后使颅内血管扩张、充血或静脉窦被牵拉而引起的，或者是由于放出脑脊液过多造成颅内压减低，使由三叉神经感觉支支配的脑膜及血管组织牵拉、移位引起的头痛。
2．腰背痛及神经根痛
腰穿后的腰背痛是由于穿刺造成局部软组织损伤所致，当穿刺不当使穿刺针斜面与执业护士网韧带呈垂直方向时，可以切断韧带的纵行纤维，使韧带失去正常张力从而产生腰背部的酸痛。
3．脑疝
腰穿时由于释放过多的脑脊液，使颅腔与椎管之间的幕上分腔与幕下分腔之间的压力增大，可促使脑疝的形成。病人腰穿后应去枕平卧24小时， 严密观察病情， 注意生命体征和观察瞳孔的变化。如发现头痛、颈痛、精神萎靡、瞳孔不等大、意识屏障加重等时，则应考虑发生脑疝的可能，积极采取脱水、降颅压等措施。
4．出血
一般腰穿有创伤性出血时，大多是刺破蛛网膜或硬膜下静脉，出血量少时，很少引起临床症状。当刺破大血管，如马尾的根血管时，即可能产生大量出血，临床上类似原发性蛛网膜下腔出血。
5．感染
由于消毒不彻底或无菌操作不严格，可能导致腰穿时的感染，包括脊柱骨髓炎、椎间盘感染、硬膜外脓肿和细菌性脑膜炎等。
