为了保证尿液检验结果的准确性，必须正确收集尿液标本和保存。，盛尿容器要清洁干燥。最好使用一次性的容器（如塑料尿杯)，避免因用药并清洗不干净而造成的污染，影响检验结果。尿液标本必须新鲜，留取后，应及时送检，以免细菌繁殖。并应于留尿半小时至一小时内查完，因在室温中久置后（尤其是夏季)尿中磷酸盐等可析出结晶而干扰显微镜检查。某些化学物质，如尿胆原，可因光分解或氧化而减弱。
不同时间收集的尿液，因有不同程度的稀释，有形成分检出率较低，检验结果常相差较大。一般试验可随意留取任何时间的尿液，但以清晨尿为佳，一般留取100毫升左右即可，特殊化验时，应按特殊要求留取。一般留取24小时尿时，需上午8时嘱病人排尽尿，弃去。然后将尿全部收集，直至次日上午8时整，让病人排空膀胱中的尿液，并收集在一清洁干燥的大容器中（若留取12小时尿液时，一般应在晚8 时至早8时这段时间较好)，充分混匀后测量24小时（或12 小时)尿总量，并记录，再取100毫升～200毫升尿置清洁干燥容器内送检。同时将24小时（或12小时)尿总量报告化验室。凡尿液化学成分的定量检查，如尿糖、尿蛋白、尿17 羟皮质类固醇及17羟酮类固醇等定量，大多用24小时尿标本。做尿糖检查时：应留空腹尿，否则应注明进餐后留尿时间，其它特殊化验，应按试验要求留取标本，如酚红排泄试验等。
对女性病人（无论成人或幼女)最好先清洗外阴后再留标本，以防阴道分泌物污染尿液。月经期间不宜留取尿液化验；男性病人留尿时，则须避免前列腺液和精液的污染。如欲进行尿培养时，则应用灭菌试管留取尿液，女性应先清洗外阴，并用消毒液消毒尿道口，留取中段尿于灭菌试管内。男性病人应事先用消毒液消毒阴茎、龟头和尿道口，然后留取中段尿于灭菌试管内。尿培养留取标本要求无菌手续较严格，不然造成污染杂菌影响化验结果。一般尿培养留取标本，在医院治疗室由护士指导进行。
尿液标本的保存：一般尿液检验应及时检查新鲜标本，如不能及时检查，或作某些特殊试验需留取大量标本时，最好放入4℃冰箱保存，若无条件应根据检查目的适当加入防腐剂。甲苯或二甲苯可阻止细菌污染，以延缓尿液中化学成分的分解。常用于尿糖、丙酮、乙酰乙酸等化学成分测定标本保存。一般于尿液表面加甲苯或二甲苯2～3毫升使成一薄层。甲醛（即福尔马林)可抑制细菌生长，并可固定尿中的细胞和管型以利保存。甲醛用量为100毫升尿液中加入约 0.5毫升即可。因甲醛有还原性醛基，不适于糖。 17羟皮质类固酵，17酮类固醇等化学成分的检查。麝香草酚，有防腐作用，常用于尿结核菌检查。另外，留24小时尿液标本时，还可在盛尿容器中加5毫升浓盐酸，此法适用于测定肾上腺素、儿茶酚胺、17羟类固醇和17酮类固醇等。
