所用原料的化学成分明确、稳定如葡萄糖、硫酸铵适于研究菌种基本代谢和过程的物质变化等科研工作；在生产某些疫苗的过程中，为了防止异性蛋白质等杂质掺入，也常用合成培养基；营养单一、价格较高，不适于大规模生产。
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