[Key words] Polysialic acid neural cell adhesion molecule; DNA methylation; Epigenetics; Synaptic plasticity
多聚唾液酸(PSA)是线形同聚物构成的多糖,其作用是通过神经细胞黏附分子(NCAM)介导。因此,描述PSA时,通常以PSA-NCAM的形式。PSA-NCAM在整个神经系统的发育过程中都有重要作用,如神经前体细胞的迁移[1],神经细胞的分化,突触的可塑性和空间记忆的形成[2],轴突旁路的形成[3]。本研究通过在基因水平和蛋白水平对能催化PSA合成的两种多聚唾液酸转移酶- ST8SiaII(STX)和 ST8SiaIV(PST)研究发现,调控这两种酶表达的基因转录起始区富含GC,而且还包含SP-1蛋白识别序列,同时这个识别序列也包含了CpG 序列[4],甲基化能够用来作为多聚唾液酸表达的基因外调控。
1 材料与方法
1.1 材料:组织基因组DNA提取试剂:QIAGEN公司(JP);细胞基因组DNA提取试剂:GENTRA 公司(USA);鼠抗 PSA-NCAM单克隆抗体:CHEMICON INTERNATIONAL,Inc(USA)。免疫纯化的生物素连接的山羊抗鼠 IgG+IgM抗体:Pierce Biotechnology,Inc(USA)。18d的胚胎鼠(E18)和成年小鼠C57BL/6J(山犁大学医学部动物研究中心)各50只,体重分别为100-250g。小鼠Neuron2A细胞株:山犁大学医学部环境遗传医学教室。胎牛血清和dulbeccos modified eagles medium(DMEM)来自SIGMA公司。蛋白定量试剂盒:Dojindo Molecular Technologies,Inc(JP);WizardTM DNA clean-up System:promega 公司。其他试剂购自SIGMA公司。
1.2 方法
1.2.1 小鼠神经纤维母细胞瘤的细胞株-Neuro2A,细胞培养及神经细胞和神经胶质细胞的原代培养:小鼠成纤维母细胞瘤的细胞株-Neuro2A,细胞常规复苏后,以104/cm2的密度接种于培养皿,培养液含10%(v/v)胎牛血清和青霉素/链霉素(100μg/ml)的DMEM,置37℃,5% CO2培养箱中培养。细胞培养24h后,加入终浓度为1mM的视黄酸(retinoic acid),48h后观察细胞的分化情况,细胞80%融合后传代。再加入不同浓度的丙戊酸和甲硫氨酸,48h后收集细胞,提取蛋白。
1.2.2 神经细胞和神经胶质细胞的原代培养:取18d的胚胎鼠(C57BL/6J)大脑皮层细胞分别培养在神经细胞培养液和神经胶质细胞培养液,大约2周后,细胞呈现互相连接生长。分别收集神经细胞和神经胶质细胞,提取蛋白。
1.2.3 蛋白提取:分别收集Neuro2A,神经细胞和神经胶质细胞,冷PBS洗涤细胞3次,用预冷的细胞裂解液(1% Triton X-100和1%的蛋白酶抑制剂)100μl裂解细胞(5000rpm,5min),超声波使溶液均匀透明 ,考马斯亮蓝(lowry)法测定蛋白浓度医.学全.在.线网站www.lindalemus.com。
1.2.4 DNA提取:分离成年鼠和胚胎鼠的大脑、小脑、基底核、海马,加入Proteinase K,55℃过夜消化,苯酚—氯仿抽提,酒精沉淀,干燥, TE溶解,紫外分光光度仪测量DNA浓度。
分别收集Neuro2A,神经细胞和神经胶质细胞,冷PBS洗涤细胞5次,加入细胞裂解液,震荡,再经过RNase A处理和蛋白沉淀,异丙醇抽提,酒精沉淀,TE溶解,紫外分光光度仪测量DNA浓度。
1.2.5 PSA合成的甲基化分析—甲基化特异性的PCR (methylation-specific PCR):上述提取的DNA,经过亚硫酸盐处理后作为模板进行PCR扩增反应,引物的设计围绕SP-1蛋白结合位点(引物序列见表1)。采用甲基化特异性的PCR 检测了STX和PST基因转录其始区是否发生甲基化[5]。