1.2 研究方法
1.2.1 外周血白细胞的分离
提取病例组及对照组肘静脉新鲜全血15ml,立即用EDTA抗凝。离心弃去血浆后再加淋巴分离液,移液器收集界面上的白细胞层,离心弃上清可见白色的沉淀,加入Trizol试剂,用移液器充分抽打、混匀,直到形成清亮不粘稠的液体。
1.2.2细胞总RNA的抽提与鉴定
Trizol法抽提细胞总RNA,样品经紫外分光光度计检测A230、A260、A280值,甲醛变性胶电泳检测28S、18S条带变化,鉴定样品质量是否符合表达谱芯片的实验要求。
1.2.3对样品RNA进行荧光标记
双链cDNA的合成与纯化,以cDNA为模板用随机引物和Klenow酶进行DNA链的标记,并在DNA链延伸过程中掺入荧光素。
1.2.4杂交与清洗
将标记的DNA溶于杂交液中42℃杂交过夜,清洗后玻片甩干即可用于扫描。
1.2.5信号扫描和分析
芯片用ScanArray Express双通道激光扫描仪进行扫描,分别得到子痫前期外周血cDNA的Cy5图像文件和正常妊娠外周血的Cy3图像文件。采用GenePix Pro 4.0图像分析软件分析Cy3和Cy5两种荧光信号的强度和比值,对芯片上的数据用Lowess方法进行归一化;最后以差异为两倍的标准来确定差异表达基因。比值>2.0表示子痫前期外周血基因表达水平高于正常妊娠,比值<0.5则显示子痫前期外周血基因表达水平低于正常妊娠。
2结果
2.1总RNA抽提与鉴定结果医.学全.在.线网站www.lindalemus.com
样本的总RNA经紫外分光A230、A260、A280测定,甲醛变性胶电泳检验RNA样品质量符合表达谱芯片实验要求。OD260/OD280值为1.714~1.965,均介于1.7~2.1之间。结果显示总RNA无降解,28S、18S条带清晰,28S比18S的亮度接近2∶1,提示得到高纯化的总RNA。
2.2基因表达谱芯片杂交结果
图1和图2均为Cy5荧光标记的子痫前期外周血白细胞cDNA杂交扫描图像与Cy3荧光标记的正常妊娠外周血白细胞cDNA杂交扫描图像的叠加图像。在图像中,如果Cy3信号较强,该点呈绿色,表示该基因呈下调趋势;如果Cy5信号较强,该点呈红色,表示该基因呈上调趋势。在两种外周血中表达水平相当的显黄色,而均不表达的则为无色。图1显示肿瘤坏死因子(TNF-α)在子痫前期外周血表达增高,Cy5信号较强,呈红色。图2显示白介素-4受体(IL4R)在子痫前期外周血表达降低,Cy3信号较强,呈绿色。