本刊是医药卫生类综合性的高级学术性期刊，国内外公开发行。主要登载我校基础医学院、各附属医院、各临床医学院、各研究所（中心，室)在医、教、研方面的新成果、新经验、新技术。曾用刊名：上海第二医学院学报；上海第二医科大学学报。
上海交通大学学报·医学版期刊荣誉：
本刊获奖情况：中国科技核心期刊、中国医学核心期刊；该刊被以下数据库收录：CA化学文摘（美)（2009)、CBST科学技术文献速报（日)（2009)、中国科学引文数据库（CSCD—2008)。
上海交通大学学报·医学版栏目设置：
本刊主要栏目：基础医学研究；临床医学研究；病例报告；综述；短篇；预防医学；医、教、研管理与改革。
该刊被以下数据库收录：
CA 化学文摘(美)(2014)
JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)(2013)
Pж(AJ) 文摘杂志(俄)(2014)
CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(2015-2016年度)(含扩展版)
2015年版中国科技期刊引证报告（核心版)
北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊： 2004年版, 2008年版, 2011年版, 2014年版
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