《中国中医基础医学杂志》1995年创刊，是由国家中医药管理局主管、中国中医科学（研究)院基础理论研究所主办，以集中、快速反映我国中医基础理论研究最新成果、最新进展为特色的全国唯一一家中医理论研究期刊。杂志依托中国中医科学（研究)院和中医基础理论研究所雄厚的专业人才队伍，在导向中医基础理论研究，坚守中医理论阵地方面发挥了重要作用，成为中医理论研究、教学、科研、临床工作者认真关注的理论性研究期刊。对我国中医基础理论研究受重视程度的提高和研究队伍的扩大，起到了积极的促进作用。《中国中医基础医学杂志》已经成为我国中医基础理论研究的垫脚石，正在为中医学术水平的不断提高与健康发展推波助澜。
中国中医基础医学杂志发展历程：
《中国中医基础医学杂志》创刊十年来，树立推动中医基础理论研究，促进中医学术发展的办刊宗旨，逐渐形成并张扬自己的学术风格。立足于中医基础理论研究前沿，坚持继承与发展并重，探索新理论，研究新方法，提倡理论研究带动实验研究，基础研究结合应用研究。鼓励探索争鸣反思，支持继承发扬创新。尤其在理论探讨方面，颇多发表思考深刻、见地独特、启迪性强的研究性论文。愿意在引领与启迪中医基础理论研究与发展走向上，能够起到《中国中医基础医学杂志》应有的影响与作用。
十年来着重发表具有启迪创新内容的有关基础理论探讨，基础实验研究，方法学探讨，临床理论总结，国家与地区自然科学基金、科技部、中医药管理局、教委等资助项目的研究论文等。
由于作者与读者的需求不断扩大，从创刊时的季刊，1996年增为双月刊，1998年增为月刊。正文页码从创刊时的64页，至2001年增为80页。发行量约36200册。
中国中医基础医学杂志栏目设置：
主要栏目：理论探讨，专家论坛，学术争鸣，实验研究，临床基础，中医方法学，多学科研究，中医文化，医家学术思想研究，经络研究，基层园地等。
中国中医基础医学杂志收录情况：
十年树木，2004年杂志进入中文核心期刊。目前是中文核心期刊·中国医学类核心期刊，中国学术期刊数据库全文检索期刊，中国科学引文数据库扩展库期刊，中国生物学文摘和文献数据库期刊。百年树人，展望未来，《中国中医基础医学杂志》必将随着中医事业的健康发展，为中医基础理论人才的不断涌现与茁壮成长铺路架梁。
《中国中医基础医学杂志》被以下数据库收录：
CA 化学文摘(美)(2014)
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