（3)学科性质对影响因子的影响。SCI收录期刊数量呈现出明显的学科差异，大的和热门学科被收录的期刊数较多。如1996年SCI收录的4500种期刊中，大约有3000种与生物医学有关。收录该学科期刊越多，就意味着该学科期刊的参考文献引证和被引证的机会大大增加，影响因子随之大大增大。如1997年生化类刊物中最高影响因子值为40.782，而数学类刊物中最高值仅为2.070；该年度IF=1.0的刊物在生物化学和分子生物学类刊物中位于第194位，在数学类刊物中位于第7位。2005年，SCI－JCR中，影响因子排在前10位者，有7种属于生物医学期刊，而Nature和Science虽然不属于生物医学期刊，但其发表的论文大部分属于生命科学（约占60％)。
（4)论文类型对影响因子的影响。综述类、方法类和有争议的论文被引用机会明显高。综述类论文具有较高的文献情报价值，而且往往是由知名和权威作者撰写，因而往往由于其本身的质量和作者的知名度而获得较多的被引用次数。方法类论文往往是因为建立一种新的研究方法而被研究人员广泛引用。如Lowry于1951年发表的一篇有关蛋白质测定的方法性论文，在1994年被引证8000多次（总被引频次超过25万次)。有争议的论文往往有很多作者广泛参与讨论，因而被引用的机会大大增加，尽管多数是批判性引用，它仍然参与影响因子的计算。
（5)其他因素对影响因子的影响。SCI规定，期刊前两年发表论文总篇数是指论文（Articles)、简讯（Notes)和综述（Reviews)等的总数，而述评（Editorials)、来信（Letters)、通讯（Correspondence)和其他一些常被引证的栏目的文章数目则不进行统计。因而，统计条目统计的差异也对影响因子有着明显的影响。大量的统计表明，论文的平均作者数与论文的被引频次呈显著的正相关。因而，论文平均作者数越多，期刊的影响因子越高；期刊越大、平均论文长度越长、期刊库收录期刊平均引文数越多，期刊的影响因子越大。各期刊文后参考文献数越多，互相引用和被引用的机会越多，期刊的影响因子越大。我国科技期刊前些年都限制作者引用参考文献数量，期刊之间互相引用和被引用的机会就大大减少，这是导致中国期刊影响因子较低的原因之一。近年来，国内期刊在这方面有了较大进步，篇均引文数逐年增加。
三、分析和讨论
一般来讲，同一学科的论文，质量越高被引用的机会越多。但也并不是绝对的，例如在医学研究领域，绝大部分临床医生更喜欢阅读较为实用的临床研究论文，而对高质量的实验研究论文不感兴趣或根本看不懂。这就导致了高质量实验研究论文被引用的机会可能远低于临床研究论文。从以上介绍可知，影响因子的影响因素中，多数是非期刊质量因素，因而我认为，并不能说哪个期刊影响因子越高，其学术质量越高。有很多高校和科研机构声明，在英国的Nature和美国的Science这两个期刊发表一篇论文，奖励论文作者10～20万元，而这2个期刊的影响因子在SCI收录的期刊中并不是最高的，2004年JCR中，Nature和Science的影响因子分别是32.182和31.853，分别排在第9和第10名。影响因子排在第一位的是AnnualReviewofImmunology（《免疫学评论年鉴》)，其影响因子为52.431。况且，过度自引（主要指期刊自引，即某期刊引用本刊以前发表的论文做参考文献)和批判性引用都对期刊的影响因子发挥着不应该发挥的作用。2004年，SCI收录的中国科技期刊中，影响因子最高的是WorldJournalofGastroenterology(《世界胃肠病学杂志》英文版)，其影响因子为3.318，但由于其过度自引，2005年SCI宣布不再收录该期刊医学.全.在.线.提供.
www.lindalemus.com。为什么中国影响因子最高的杂志却不再被SCI收录？这应该引起我们的重视。
因此，过分渲染SCI及期刊影响因子在科研绩效评价中的作用是不科学、不严谨的。适当引导和鼓励国内科研人员在国际重要期刊发表论文，给予适当重奖是合理的，也是必要的，但过度重视和奖励SCI收录的论文，是不明智的，这可能会导致资金使用的浪费。同样是SCI收录的期刊或者论文，其质量差别也很大。况且，期刊质量并不等同于论文质量，影响较大的期刊发表的论文不一定都是高质量的，而影响一般的期刊也会发表一些质量很高的论文。Crebs关于三羧酸循环的重大发现，其研究论文先投到Nature杂志而遭到退稿，后改投EnzymeChemistry（《酶化学》)杂志而得以发表，后来获得了诺贝尔奖。如果理智一点的话，我们不应该按照期刊的级别和影响作为论文的奖励依据，而应该根据论文本身的质量和价值进行奖励。按论文发表后被引用的次数进行奖励，相对来说更为合理，也可能成为我国高校今后科研奖励的发展方向。
值得说明的是，将SCI作为重要的评估指标医学.全.在.线.提供.
www.lindalemus.com，是远东地区（包括日本、韩国、新加坡、及中国的两岸和香港等)的特色。在科学发达的美国，也是SCI的诞生国，SCI并未被广泛地用来作为科学研究绩效的评估标准。
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