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（1)MeSH转换表（MeSH Translation Table)，包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词)进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
（2)刊名转换表（Journal Tanslation Table)，包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。
（3)短语表（Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System)论.文.客.服.QQ，81995535和补充概念（物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短词表。
（4)著者索引（Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND)在全部字段中检索。如："single cell"，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“single AND cell”。
要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。
2.截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter *”，系统会找到那些前一部分是bacter的单词（如bacteria, bacterium, bacteriophage等)，并对其分别进行检索。如果这咱词少于150个，PubMed会逐个词检索，若超过150个（如：Staph*),PubMed将显示如下警告信息：“Wildcard search for 'term*' used only the first 150 variations. Lengthen the root word to search for all endings"。截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等。
使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。
3.强制检索功能 如上所述，在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”，系统会高速用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索论.文.客.服.QQ，81995535；但是，当键入的词语无匹配词时，PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程，若仍然没有匹配词，系统就将短语分解成单词，再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显，这样检索的结果是不符合用户要求的。因此，PubMed允许使用双引号（“”)来强制系统进行短语检索。例如，在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”，并用双引号引起来，然后点击“Go”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。
4.链接功能
（1)链接相关文献。PubMed系统中的每条文献记录均有一个相关文献链接，在检索结果的显示状态下，每条记录的右边均有“Related Articles”超链。点击该链，系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。 利用检索史（History)按钮能进一步限制相关文献。点击“History”，把相关检索式的编号录入检索提问框，然后再键入附加条件词，最后点“Go”。如在检索提问框中键入“#7 AND english[la]”，可将检索进一步限定在英文文献范围内。
（2)链接NCBI（National Center for Biotechnology Information)数据库。PubMed在其主页上与NCBI的5个数据库建立了超链接。这些数据库包括：Protein[氨基酸（蛋白质)序列]数据库，Nucleotide(DNA序列)数据库，Popset(种群、种系发生或突变序列)数据库医学全在,线www.lindalemus.com，Structure（分子结构模型)数据库和Genome(基因组序列)数据库。
（3)链接外部资源。PubMed提供从检索结果到期刊全文、生物学数据、序列中心等的链接。该功能通过链接上述资源站点的方式来实现。在检索结果显示状态下，点击“LinkOut”进入相关网站。
（4)链接相关图书。点击“Books”，可参考相关书籍的文摘页。书籍文摘页上的某些短语是超链接，点击短语超链，可连到相关图书的页码表，可在表上找到有关短语。
此外，PubMed系统允许用户查看被引期刊名称表，点击主页上的PubMed Journal power即可，PubMed向用户提供期刊的缩写名称和ISSN号。
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