《琼瑶神书》，约成书于元末明初，作者为兼通针术的道人。经考证，题曰“琼瑶神书”之书至少有三种。其一，《琼瑶神书》三卷（今佚)；其二，明刊《琼瑶发明神书》三卷（又作“琼瑶真人针经”)，此乃后人伪作，与前书内容迥然不同；其三，清刊《琼瑶神书》四卷（又作“琼瑶神书大成”)。此本真伪参半，其卷三末补有两部与原书内容完全无关的医书，别卷也间有后人增补之文。