（五)眼
1．眼睑翻开（Gaping Lids,gp):出生时眼睑开放，角膜不透明，从妊娠的第15天起晶状体增大，并有裂唇。
2．眼睑翻开（Open Eyelids,oe):出生时眼睑翻开，角膜混浊，有些发生小眼，晶状体和视网膜错位，角膜也可能发生错位。
3．小眼畸形（Microphthalmia,mi)：眼小，眼腔闭合，常有白内障，多数mi/mi死于断奶年龄左右，严重的有骨骼缺陷。
4．白内障（Catarait,cat)：晶状体呈乳白色，出生时混浊，患白内障。
5．异位（Ectopic,ec):5周龄发生晶状体混浊，晶状体囊破裂，核异位。
6．水晶体破裂（Lens-Rupture,lr):白内障开始于3周龄左右，晶状体囊破裂，晶状体异位到玻璃体中。
7．眼迟钝（Ocular Retardation,or):眼迟钝，纯合体在出生时眼小，中间动脉和静脉不发育，视神经和视交叉缺乏。
8．视网膜变性（Retianl Degeneration,rd):视网膜变性，从10月龄开始光感受细胞即不发育，到20日龄时，杆细胞缺乏，神经节和两极细胞层完整。
（六)皮肤
1．无毛（Hairless,hr)：为无毛鼠，与nu/nu差不多，但有区别。6个月龄后胸腺皮质萎缩，CVH降低，细胞免疫性降低，GMULV滴度增加，体液免疫反应性降低，接触性、敏感性都降低。
2．无毛（Rhino,hrrh):是hr无毛的等位基因，表现型与无毛相似，但一般来说缺陷更严重。
3．裸体（Nakek,N)：杂合体胎毛生长几乎正常，但从10～14日龄起即开始脱落，并循环发生，从而引起周期性的秃斑和毛斑。纯合体出生时无触须。少数能存活到繁殖期。
4．缺皮脂（Asebia,ad):ab/ab鼠的皮肤上有发育不良的毛并完全缺乏脂腺，毛囊数目减少（缺乏毛囊)。
5．鱼鳞状皮肤（Ichthyosis,ic):6日龄鼠皮肤粗糙且呈乳头状，体侧、体背和尾部的皮肤出现破裂，2周龄时毛被稀薄，短且卷曲，3～4周龄时，皮肤变得干燥，硬实，且呈鳞状，然后破裂胶落，常见有真皮层的继发感染。
（七)肌肉系统
1．肌肉发良不全（Muscular Dysgenesis,mdg):mdg/mdg小鼠的骨骼上的成肌细胞不分化，出生时常发生死胎或出生后很短时间死亡。其体型短而宽，皮肤松驰而光滑，颌小和腭裂。
2．肌营养不良（Muscular Dystrophy,dy):发生于129J小鼠。病鼠（dy/dy)在出生时活的，但大约到3周龄开始表现进行性肌衰弱和广泛性的肌萎缩，无生殖力dy/dy雌鼠的卵巢移植到正常雌鼠体内是具有生殖力的。该鼠肌纤维较正常的大或小，结缔组织量增加，有些区域肌纤维被脂肪组织代替，肌原纤维渐进性丧失。
（八)骨骼系统
1．小眼畸形（Microphthalmia,mi)眼小，常有晶状体白内障和视网膜裂。门龄通常不冒出牙床，长骨缺乏正常的重建，使长骨变短，其近端呈圆锥形，在骺后下方不形成正常骨头的特征性形状。
2．并趾畸形（Syndactylism,Sm)发生A/Fa近义系小鼠中，sm/sm小鼠的四只脚均受到影响，多数鼠第三和第四趾是融合在一起的，有些鼠的第一和第二趾也是这样，前足的趾联合是软组织的融合，而后足的趾是骨融合引起。
3．皮肤增厚（Ｔight－skin,TSK)发现于B10·D2（58N)/Sn近交小鼠中。病鼠皮肤增厚，颈和肩部的皮肤更紧。TSK/+鼠的结缔组织、软骨和骨生长过度，胸廓扩大，发生肺气肿。
４．多并趾（Polysyndactyly,PS)ps/+小鼠表现为轴后多并趾以及并趾加姆趾轴前碎裂。在后足，拇趾（第一代或大的爪)，厚而短，其它趾可变短或融合。
5．摇摆和并趾畸形（Shaker-with-synda-ctylism,sy),sy/sy鼠并趾（软组织联合或骨性联合)在四只脚均可表现，长骨较细，迷路异常，中间充质组织过多，造成部分内淋巴间隙萎缩，最终发生膜迷路的变性，动物发生仰头、转圈和耳聋。
6．软骨发育不全（Achondroplasia,Cn)Cn/Cn小鼠腿短，趾短而粗，脊柱短，尾短而粗，头呈圆顶形，上颌缩短而呈“叭喇狗”外形，牙齿错位咬合，鼻短而宽（可造成发绀)。
7．短而宽的畸形突变鼠（Brachymorphic,bm)；垂耳（Droopy-Ear,de)；短头突变鼠（Short-head,Sho)；矮胖（Stubby,stb)突变鼠。
此外尚有：短肢（Phocomelic,PC)，短趾（Hypodactyly,Hd)，多趾（Extra-toes,xt)，短尾（short-tail,Sd),驼背（Kyphoscoliosis,Ky)，少趾（Oligodactyly,ol)，短耳（Short-Ear,se)，显性半肢畸形（Dominant Hemimelia,dh)等。
（九)血液、淋巴和免疫系统
1．米色突变小鼠（Beige mouse)：鼠全身被毛基部以及耳和尾巴皮肤的色素减少，病鼠眼色淡，对感染的易感性高，出血性素质以及某些细胞中出现异常颗粒。其色素变化是由于这种突变体发生部分白化的结果。这些症状与人类、牛和水貂的部分白化相似。因此米色小鼠可作为Chediak-Higashi综合征的一个模型。
2．泡沫细胞性网状细胞增多（Foam cell Neticulosis)小鼠：这种鼠病与人类Gaucker氏和Nieman-pick氏病相似。发现于3月龄的CBA小鼠，淋巴器官发生明显改变，胸腺肿大不透明，纵隔和系膜淋巴结也常发生类似的变化。正常组织被大巨噬细胞（直径15～40μ)所代替，这些泡沫细胞的胞浆中含有多量脂肪等物质。
3．能活的黄色（Viable yellow,AVY)小鼠：免疫研究用，GVH下降，对肝癌、乳腺癌、胆管瘤的易感性降低，易发生肥胖症。
Ay:yellow与Avg相似。
4．米黄色（Beige,bg)小鼠：影响颗粒细胞的趋化性，降低对肺炎的易感性，降低对金黄葡萄球菌的杀伤力，如人的Chediak-Higashi综合?开。医.学.全.在线.网.站.提供
5.Ames矮小（Ames dwarf,df)小鼠：有很多免疫缺陷，断奶后胸腺萎缩，血中淋巴球减少症（Lymphopenia),GVH降低，对PHA与Con-A反应低，SRBC体液反应降低，垂体功能缺陷。
6.显性半肢畸形（Dominant himimelia,Dh)小鼠：半肢畸形显性，淋巴结大，白细胞增多，网状内皮系统功能降低，脾脏缺乏，后肢少一块骨头。
7.矮小（Dwarf,dw)小鼠：断奶后胸腺萎缩，胸腺激素降低，GVH降低，对SRBC反应降低，自家免疫性降低。
8.无毛（Hairless,hr)小鼠：无毛鼠与nu/nu差不多，但与nu/nu有区别，6月后胸腺皮质萎缩，GVH降低，细胞免疫性降低，接触性敏感性降低。
9.嗜睡（Lethargy,lh)小鼠：嗜眠症（是容易睡觉的品系)，胸腺与脾脏的大小缩小，胸腺25天萎缩，Peyer′s斑减少，血中淋巴球减少，GVH移植反应降低，45天前死亡。
10.淋巴细胞增生（Lymphoproliferation,Lpr)小鼠：淋巴细胞增生是一对隐性基因，40周龄前有大的淋巴结，免疫球蛋白增加，高免疫复合物引起的肾炎，有风湿样关节炎。
11.脂多糖应答（Lipopolysaccharide response,LPS)小鼠：对脂多糖体液与引起丝状分裂（Mitogemic)的应答减少。
用两种小鼠C3H/HeJ与BL/10ScCr同型合子做实验时发现对内毒素抵抗力增强，其它则对内毒素敏感，研究这两类小鼠对内毒素反应可提供人类对内毒素的反应，包括内毒素引起休克等等。
Lps是细菌外壳革兰氏阴性。抗原成分Lps内毒素在体内可刺激许多的细胞，包括B细胞、巨噬细胞、纤维母细胞、T细胞均可受到Lps作用，杀肿细胞能力降低，由于突变，可有很多的指标测定其变化。
12．早蛀（Motheaton,Me)小鼠：影响免疫系统的隐生突变，引起T及B细胞的免疫缺陷，脾大，胸腺缩小，淋巴结减少，无GVH反应，对羊红细胞反应极少，对各种突变原反应降低，多克隆高免疫球蛋白血症，抗DNA抗体增加，免疫复合物肾炎增加。
13．肥胖（Obese,ob)小鼠：对羊红细胞（SRBC)反应降低，血清里的IgG减少，对同种异体移植排斥延迟，肥胖病（obesity)，高胰岛细胞减少（B细胞的演化发生成熟均减少)，降低对sss-ⅢIgM 反应（肺炎双球菌多糖第Ⅲ型IgM反应)，对依赖胸腺抗原的反应降低。其它特点同前述。
