三、蛋白质的结构与功能的关系
(一)蛋白质的一级结构与其构象及功能的关系
蛋白质一级结构是空间结构的基础,特定的空间构象主要是由蛋白质分子中肽链和侧链R基团形成的次级键来维持,在生物体内,蛋白质的多肽链一旦被合成后,即可根据一级结构的特点自然折叠和盘曲,形成一定的空间构象。
Anfinsen以一条肽链的蛋白质核糖核酸酶为对象,研究二硫键的还原和氧化问题,发现该酶的124个氨基酸残基构成的多肽链中存在四对二硫键,在大量β-巯基乙醇和适量尿素作用下,四对二硫键全部被还原为桽H,酶活力也全部丧失,但是如将尿素和β-巯基乙醇除去,并在有氧条件下使巯基缓慢氧化成二硫键,此时酶的活力水平可接近于天然的酶。Anfinsen在此基础上认为蛋白质的一级结构决定了它的二级、三级结构,即由一级结构可以自动地发展到二、三级结构(图1-10)。
一级结构相似的蛋白质,其基本构象及功能也相似,例如,不同种属的生物体分离出来的同一功能的蛋白质,其一级结构只有极少的差别,而且在系统发生上进化位置相距愈近的差异愈小(表1-2,表1-3)。
表1-2 胰岛素分子中氨基酸残基的差异部分
胰岛素来源 | 氨基酸残基的差异部分 | |||
A5 | A6 | A10 | A30 | |
人 | Thr | Ser | Ile | Thr |
猪 | Thr | Ser | Ile | Ala |
狗 | Thr | Ser | Ile | Ala |
兔 | Thr | Ser | Ile | Ser |
牛 | Ala | Ser | Val | Ala |
羊 | Ala | Gly | Val | Ala |
马 | Thr | Gly | Ile | Ala |
抹香猄 | Thr | Ser | Ile | Ala |
鲤猄 | Ala | Ser | Thr | Ala |
表1-3 细胞色素C分子中氨基酸残基的差异数目及分歧时间
不同种属 | 氨基酸残基的差异数目 | 分歧时间(百万年) |
人-猴 | 1 | 50-60 |
人-马 | 12 | 70-75 |
人-狗 | 10 | 70-75 |
猪-牛-羊 | 0 | |
马-牛 | 3 | 60-65 |
哺乳类-鸡 | 10-15 | 280 |
哺乳类-猢 | 17-21 | 400 |
脊椎动物-酵母 | 43-48 | 1,100 |
图1-11 核糖核酸酶的变性和复性示意图
(A)天然核糖核酸酶(B)变性失活(C)“错乱”核糖核酸酶
促肾上腺皮质激素(ACTH)和促黑激素(MSH)均为垂体分泌的多肽激素。α-MSH和ACTh 4~10位的氨基酸结构与β-MSH的11~17位一样,故ACTH有较弱的MSH的生理作用(图1-12)。
在蛋白质的一级结构中,参与功能活性部位的残基或处于特定构象关键部位的残基,即使在整个分子中发生一个残基的异常,那么该蛋白质的功能也会受到明显的影响。被称之为“分子病”的镰刀状红细胞性贫血仅仅是574个氨基酸残基中,一个氨基酸残基即β亚基N端的第6号氨基酸残基发生了变异所造成的,这种变异来源于基因上遗传信息的突变(如图1-13)。
图1-12 ACTH、α-MSH和β-MSH一级结构比较
正常 | DNA | ……TGt GGG CTT CTT TTT…… |
mRNA | ACA CCC GAA GAA AAA | |
DNA(β亚基) | N端…苏-脯-谷-谷-赖…… | |
异常 | DNA | ……TGT GGG GAT CTT TTT…… |
mRNA | ……ACa CCC GUA GAA AAA…… | |
hbs(β亚基) | N端…苏-脯-缬-谷-赖…… |
图1-13 镰刀状红细胞性贫血血红蛋白遗传信息的异常