肝病对药物清除，生物转化及药动学的影响非常复杂。致病因素包括药物吸收，血浆蛋白结合力，固有清除和肝廓清率，肝血流量和血管的分流量，胆汁分泌，肝内循环及肾清除能力等因素的改变。肝病时单个药物的净效应难以预测，因为它与肝脏损害的类型，严重程度及肝功能试验都没有多大的关系，这样调整肝病患者的用药就没有普遍适用的准则。

药物动力学也可发生改变，尤其是在慢性肝病；例如，慢性肝病患者通常对麻醉剂或镇静剂敏感性增强，因而似乎很小剂量就可诱发肝性脑病，其机制尚不清楚，可能与大脑药受体的改变有关。