少见的畸形(如Ebstein畸形,三尖瓣畸形),包括胎儿疾病伴发心脏病变(如宫内贫血延长,胎儿心律紊乱),与无脾综合征有关的严重的心脏畸形,以及非心脏疾病(如甲状腺功能不足)引起的心功能不全需要分别处理。
许多罕见畸形(如先天性完全性传导阻滞,先天性代谢紊乱常引起的严重的酸中毒和继发的心肌功能不全,有严重危险的QT延长综合征,胎儿心律紊乱可能),以及罕见的缺损(如三房心)需要高技术的诊断和介入治疗。