新疆医科大学第五附属医院（原乌鲁木齐铁路中心医院)成立于1937年，至今具有75年的辉煌历史。其前身为“镇江铁路医院”，1958年以“兰州基地医院”进疆后，更名为乌鲁木齐铁路局中心医院。2004年6月，随着铁路主辅分离改革，医院整建制移交新疆医科大学，成为新疆医科大学第五附属医院暨第五临床医学院。
医院总占地面积3.95万平方米，建筑面积5.53万平方米；开放床位900张；设有临床、医技等专业科室47个，行政职能科室22个；2011年全年门诊量58.31万人次，出院病人2.76万人次。
截至目前，医院在职职工1195人，专业技术人员1044人，其中高级技术人员212人，有4人享受国务院政府特殊津贴，还拥有铁道部命名的“有特殊贡献专家”、“ 优秀科技工作者”等一批拔尖人才。
长期以来，医院遵循“突出特色，重视人才，崇尚人文，遵循科学”的办院方针，逐渐形成了一批有实力的临床三级学科，有些学科进入区内同行先进序列。其中心血管内科、骨科、放射科曾是铁道部重点专科，在自治区同行中享有盛誉。近年来，医院努力打造科室特色，专科优势逐渐凸显，一批有实力的科室如：肿瘤治疗中心、骨科、泌尿外科、妇科、心脏外科、心血管内科、神经内科、内分泌科、肾病血液透析科、职业病防治科、康复医学科等逐渐脱颖而出。
医院拥有双源128层CT、1.5T MRI和西门子最新型DR，心脏彩色多普勒超声诊断仪，瑞典金宝双极反渗水处理系统及血液净化设备、全自动生化分析仪、体外碎石机、医用直线加速器、输尿管肾镜与气压弹道碎石机、前列腺汽化电切及腹腔镜、关节镜、间盘镜，尿流动力学分析仪等自治区一流的现代化医疗设备，先进的设施装备使优质的医疗服务有了保障。
作为新疆医科大学第五临床医学院，每学年承担着1万多个学时的教学、实习任务，设有内、外、妇、儿等8个临床教研室，具有教师资格的专业技术人员293人，其中博士生导师2人，硕士生导师42人，教授1人，副教授38人，讲师140人。近年来，科研工作也有了新突破，2010年获两项国家自然科学基金项目立项，同时还承担了多项自治区级科研项目和新疆医科大学科研项目。
新疆医科大学第五附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防为一体的综合性三级甲等医院。是自治区唯一一所拥有职业病临床床位的大型综合医院，是自治区医保、乌鲁木齐市医保、铁路医保、兵团医保、商业保险、新农合、全疆各地州职工城镇医保的定点医疗机构，是中西部地区儿童先天性疾病和贫困白内障患者复明救治定点医疗单位，是新市区牙病防治中心、自治区白内障定点复明医院，曾获全国“卫生文明建设先进单位”，连续六届荣获自治区级“文明单位”荣誉称号。
