一、概况
    基础医学院是国务院1981年首批批准的硕士学位授予单位，自1978年开始招收硕士研究生，现有1个博士学位授权点，10个硕士学位授权点。至今共培养硕士研究生近300名，博士研究生20余名，大多数已成为国内外高等院校、科研单位以及医疗卫生部门的骨干，其中杨焕明、贺林教授已成为我国遗传学界知名科学家。各学科点经多年的建设与发展，已成为指导力量雄厚、科研基础扎实、实验条件较好的研究生培养基地，并拥有一支以学术造诣较深的专家、教授为龙头，中青年骨干教师为主体，结构合理的教学科研队伍。有多名从国外归来的博士后学科带头人和一批有博士学位的中青年骨干教师，有“长江学者奖励计划”特聘教授岗，现有特聘教授1名。有江苏省重点学科，“发育与疾病相关基因”教育部重点实验室，江苏省医学重点实验室，国际“HLA表达与肿瘤“参考实验室。本学院与美国、英国、加拿大、瑞士、德国、日本、丹麦等国家10余所大学、科研机构建立了学术交流及合作科研、人才培养关系。科研工作稳步发展，目前承担国家杰出青年基金1项，国家自然基金16项，美国NIH基金1项，省、部级课题60余项，在研科研经费达600余万元。通过鉴定25项，获省部级二等奖及以上奖励10项，发表论文 500多篇。
二、专业设置
1.遗传学     “长江学者奖励计划”特聘教授设岗学科，具有博士学位和硕士学位授予权，主要研究方向为肿瘤发生的免疫遗传学研究；肿瘤发生的表遗传学机制研究；疾病的基因诊断与基因治疗研究；基因工程药物、疫苗的研究；基因组与生物信息学。
2.生理学   主要研究方向为神经内分泌生理；呼吸生理。
3.生物化学与分子生物学   主要研究方向为基因表达与调控；临床生化。
4.发育生物学   主要研究方向为神经发育与神经退行性疾病 ；粘细菌发育的分子机制研究 ；干细胞的基础与应用研究。
5.人体解剖学与组织胚胎学   主要研究方向为脑移植与中枢神经系统再生与修复的研究；脑血管病性脑损伤与修复机制的研究；中枢神经系统发育、再生与免疫调控。
6. 免疫学   主要研究方向为基因工程抗原抗体；免疫调节；基因免疫。
7. 病原生物学   主要研究方向为病毒感染和病毒免疫；细菌毒素。
8. 病理学与病理生理学   主要研究方向为分子肿瘤学；肝脏病理；肾脏病理。
9. 药理学   主要研究方向为神经免疫药理；心血管免疫药理。
10.生物工程领域工程硕士    主要研究方向有发育与疾病相关基因的功能研究、基因诊断与治疗、HLA与肿瘤、线粒体与人类疾病、生物分子识别与模拟等。