中药学学科1981年被批准为硕士学位授权学科点，1986年批准为博士学位授权学科点，1998年获准设立中药学博士后科研流动站。中药学科下设中药化学、中药制剂学、中药生药学、中药药理学和临床中药学五个学科。自授权招生以来，各学科根据自身发展的需要，培养了不同研究方向的研究生。到目前为止，已培养博士研究生48名，硕士研究生119名。近年来，研究生招生人数逐年增加，现在读博士研究生58名。硕士研究生77名。
目前，中药学学科有博士研究生导师17名（含中国工程院院士1名，兼职导师6名)，硕士研究生导师46名。研究生导师除承担在校本专科生、研究生的培养外，还承担在职人员以同等学历申请学位人员的培养及研究生班的教学。
中药学院现有北京市重点实验室1个、教育部高等学校中药现代化网上合作中心1个、教育部中药制药与新药开发关键技术工程研究中心1个；有中药基础与新药研究中心1个、测试中心1个及开展中药中试研究的基础平台。拥有液相色谱－质谱联用仪、气相色谱－质谱联用仪、薄层扫描仪、气相色谱仪、分析型高效液相色谱仪、制备型高效液相色谱仪、毛细管电色谱、电化学检测系统、各种生理生化检测仪器，学院拥有国家生命科学与技术人才培养基地，基地有开展各种生物研究的仪器、设备和实验条件及满足常规实验所需的分析测试仪器等现代化试验设备。良好的教学、科研硬件设施和条件，为研究生的培养、教育奠定了坚实的基础。
 经过二十余年的研究生教育与培养，学院在学科配置、师资力量、研究生方向与内容及硬件条件等建设日趋合理完善，综合实力和整体水平不断提高。已形成了较为完整的教学、科研体系。