历史沿革：上海交通大学医学院地处上海市中心繁华地区，前身是上海第二医科大学。原上海第二医科大学由圣约翰大学医学院(1896-1952)、震旦大学医学院(1911-1952)、同德医学院(1918-1952)于1952年全国高等学校院系调整时合并而成。1997年学校通过了“211工程”正式立项，是国家重点建设的“211工程”大学之一。2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，新的上海交大医学院成立，崭新的上海交大医学院由教育部、上海市政府继续重点共建。
　　实力规模：学院现有教职医护员工13000余人，其中具有高级职称的在职人员1394名；中国科学院院士1人，中国工程院院士10人，国家“973”项目首席科学家4人（6项)，长江学者计划特聘教授4人；长江学者计划讲座教授1人；获国家劳动人事部授予有突出贡献中青年科技专家称号的10人；国家“杰出专业技术人才”2人，国家杰出青年基金获得者7人，教育部“跨世纪人才计划”3人，卫生部“有突出贡献中青年专家”3人，享受国务院颁发的政府特殊津贴293人。1人获首届“上海市教育功臣”称号,3人获“上海市科技精英”称号，1人获世界十大杰出女科学家提名奖。市级以上重点学科带头人36人；博士生导师206人，硕士生导师571人；200人次在国际学术机构及国内一、二级学术团体内担任要职。
　　学院现有基础医学院、临床医学院、口腔医学院、儿科医学院、公共卫生学院、护理学院、卫生技术学院和检验系、营养系、生物医学工程系、药学系等18个二级学院（系)，7所综合性附属医院及3所专科性附属医院，15所教学医院及教学中心。有临床医学八年制硕博连读专业、八年一贯制临床医学专业、临床和口腔2个七年制专业及临床、口腔、医学检验、护理、生物医学工程、公共事业管理、营养、市场营销、药学9个本科专业。有博士后流动站4个，一级学科博士点5个，二级学科博士点51个，二级学科硕士点48个。目前在校本科及以上学生6275名，其中研究生占近50％。医学全在线www.med126.com
　　学院现有国家教育部重点学科6个，上海市重点学科11个（其中“重中之重”学科2个)，上海市教委重点学科23个，上海市医学领先专业重点学科9个，上海市临床医学中心15个。有国家重点实验室2个，教育部重点实验室2个，卫生部重点实验室5个，上海市重点实验室13个，世界卫生组织（WHO)合作中心3个，上海市级研究所21个；10个学科列入“211工程”重点建设学科。
　　科研能力：医学院学科优势明显，科研成果卓著，科研项目经费数始终在国内医学院校中处于领先地位。自“九五”期间进入“211工程”建设以来，医学院获得各级各类纵向科研项目2319项，总经费48885万元，其中国家级科研项目经费26271万元，占总经费的53.7%。国家项目中包括国家重点基础研究项目（973)6项，国家自然科学基金重大项目2项、重点项目9项，国家高技术研究发展项目（863)44项。“九五”以来，医学院共获得市（部)级科技成果奖335项，其中国家自然科学二等奖3项，国家科技进步奖17项，国家发明奖3项。近年来，被〈SCI〉收录的论文数逐年大幅度上升，〈SCI〉单篇论文引证数居全国前列。科研项目、科研经费及国家重大重点项目承担数在全国医学院校中处于领先地位。
　　办学特色：在一百多年的办学历史和五十多年的建校历程中，医学院坚持发扬“海纳百川、博采众长”的优良传统；大力弘扬“博极医源、精勤不倦”的医学院精神。具有临床医学教学条件优裕，临床医学教育和研究相结合；办学模式多元化、人才培养复合型、课程体系多样化、教学方法灵活、积极吸纳国内外先进的办学经验和教学理念的优势和特色。与中国科学院上海生命学院合作成立了健康研究中心，联合开展科学研究。
　　在国际上：同法国、美国、日本、比利时、澳大利亚、瑞典、香港等19个国家和地区的61所大学及科研机构开展了广泛的合作与交流；聘请了256位外国专家为名誉教授、顾问教授和客座教授；并与世界卫生组织、联合国人口基金会、香港华夏基金会、美国民间健康基金会有着广泛的合作。中法合作办学的临床医学七年制法文班，是中法两国政府的重点合作项目之一。学生在校以法语为第一外语，部分基础课程以法语授课。每年由法方派遣教授来院参与教学。经考核合格者被选送赴法国的医院，作为实习住院医师培训一年。