南京医科大学公共卫生学院的前身可追溯到1940年的江苏医学院公共卫生教研室。60多年来，尤其是改革开放以来，在学校（学院)党政和各级政府相关部门的领导和扶持下，在以我国著名的公共卫生学教授邵象伊主任、营养与食品卫生学和毒理学教授马凤楼主任、卫生统计学教授熊宗璠主任等四代领导集体和全院教职员工的共同努力下，秉承“博学至精明德至善”的校训精神，坚持“医学与人文相通、教学与科研并重、基础与应用结合”的办学理念，目前已建成公共卫生与预防医学一级学科博士学位授权点，公共卫生与预防医学博士后科研流动站和全国首批公共卫生硕士(MPH)培养基地。现有教职员工101人，高级职称者33人。目前在校博士和硕士研究生120人，MPH学员170人，预防医学本科生500人。学院现有1个省部共建教育部现代毒理学重点实验室，1个国家级精品课程—卫生毒理学，1个省级重点学科-劳动卫生与环境卫生学、2个省级重点实验室-应用毒理学和医药农药兽药安全性评价与研究中心、1个省级预防医学品牌专业建设点、1个省级预防医学实验教学示范中心、2个校级重点学科-流行病与卫生统计学和营养与食品卫生学。学院现承担国家杰出青年科学基金1项、国家973项目分题4项、国家自然科学基金项目24项，在保健食品功能、医药农药兽药安全性评价等社会服务方面取得了较好的社会效益和经济效益。

        2004年在教育部组织的学科评估中，我校“公共卫生与预防医学”一级学科名列全国第八位。