学校设有临床医学（五年制、七年制)、预防医学、法医学、口腔医学、医学影像学、麻醉学、护理学、药学、中药学、药物制剂、医学检验、生物制药、社会工作、信息管理与信息系统（医药方向)、公共事业管理（卫生事业管理方向)、英语（医学方向)16个本科专业。其中，七年制临床医学专业是山西省唯一的长学制专业。
学校生理学为国家重点学科，生物学、公共卫生与预防医学、临床医学3 个一级学科设有博士后科研流动站，细胞生理学实验室为省部共建教育部重点实验室www.lindalemus.com，临床医学、预防医学、法医学、药学、护理学5个专业为国家级特色专业建设点，临床技能实训中心为国家级实验教学示范中心，骨科学、重症医学科为国家临床重点专科；另有10个省级重点学科、3个省重点实验室、7个省级品牌专业、7个省级特色专业建设项目，6个省级实验教学示范中心、2个省级工程研究中心。学校是全国首批硕士学位、学士学位授权单位，山西省首批博士学位授权单位，全国临床医学专业硕士学位、公共卫生专业硕士学位试点单位，现有生物学、临床医学、公共卫生与预防医学、护理学4个一级学科、37个二级学科具有博士学位授予权，生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、中药学、护理学7个一级学科、54个二级学科具有硕士学位授予权。
“十二五”开局之年，学校共承担国家级、省部级科技计划项目224项，学科建设与科研总经费5128万元；在国际性和国家级期刊发表科研论文1200余篇，其中SCI收录论文109篇；出版教材著作74部；获省部级科技奖励54项，获专利授权18项。
直属附属医院中，第一医院、第二医院是山西省规模最大的综合性三级甲等医院，全国百姓放心医院，共开放床位 2570张，技术力量雄厚www.lindalemus.com，医疗水平领先；口腔医院是省内唯一一所三级乙等口腔专科医院，拥有日本森田3D牙科CT机、德国西门子数字化全景机等一批先进医疗设备，开放牙科综合治疗椅76台。
学校与美国、德国、澳大利亚、意大利、日本以及香港、台湾等多个国家和地区的大学和机构建立了教育、科技、医疗合作关系，并开展了多项实质性的交流合作。
经过九十多年的薪火相传，经过几代人的艰辛拼搏，山西医科大学取得了辉煌的成就。在未来的征程中，学校将继承优良办学传统，抓住发展机遇，加快发展步伐，为建成建好特色鲜明的教学研究型医科大学而努力奋斗。
