4.李继承，宋英，丁世萍，李民驹，张咸宁，周妙妮，管涛，宓开鸿，鈄金法。2006年浙江省科学技术奖三等奖：“中国人先天性巨结肠症的分子遗传学研究”。
5.张咸宁，邵吉民，李继承。全国高等医学教育学会基础医学教育分会www.lindalemus.com、中华医学会医学教育分会基础医学教育研究会第六次学术大会优秀论文三等奖：“医学本科生应加强现代分子医学科研理念的训练”。
6.李继承，宋英，丁世萍，李民驹，张咸宁。2006年浙江省高校科研成果奖一等奖：“中国人先天性巨结肠症的分子遗传学研究”。
7.2005年度浙江大学优秀教师奖。
8.张咸宁，毛薇，何新辉，陈辉，陈衡平，郭俊明，乐燕萍。2005年宁波市科技进步二等奖：“现代分子诊断技术的建立、应用及研究”。
9.张咸宁，江三多，乐燕萍，钱伊萍，汪栋祥。2001-2002年宁波市自然科学优秀论文一等奖：“精神分裂症患者染色体D6S296等微卫星标志的多态性分析”。
10.张咸宁。2003年宁波市首届教学成果奖一等奖：“医学遗传学教学改革与实践”。
11.2001年“宁波大学王宽诚育才奖”。
12.2000年上海市科协第8届青年优秀科技论文二等奖：“Cloning and mapping of a novel human serum/glucocorticoid regulated kinase-like gene, SGKL, to chromosome 8q12.3-q13.1”。（排名第6)
13.1999年上海市高校优秀教材三等奖：《医学遗传学》（第2版)，上海医科大学出版社，1998。（参编)
14.邹宇、夏蓓莉、张咸宁、陈秀珍、李采娟、李乃忠。1995年上海市科技进步二等奖：“Wilson病的群体、生化、体细胞及分子遗传学研究”。

主编、参编的学术著作、教材：
1.张咸宁，等主编。《Thompson & Thompson Genetics in Medicine，7th ed》（双语版)，北京大学医学出版社，2009。
2.左 伋主编。《医学遗传学》（第5版)，人民卫生出版社，2008。（参编)
3.左 伋主编。《医学遗传学学习指导与习题集》（第2版)，人民卫生出版社，2008。（参编)
4.傅松滨，陈 峰主编。《医学生物学学习指导与习题集》（第3版)，人民卫生出版社，2008。（参编)
5.陆国辉，徐湘民主编。《临床遗传谘询》，北京大学医学出版社，2007。（参编)
6.李继承主编，张咸宁等副主编。《医学细胞生物学》，浙江大学出版社，2005。
7.李继承主编，张咸宁等副主编。《医学细胞生物学复习纲要和练习》，浙江大学出版社，2005。
8.吴青峰，左 伋主编。《医学细胞生物学》，复旦大学出版社，2004。（参编)
9.左 伋主编。《医学遗传学学习指导》，人民卫生出版社，2004。（参编)
10.左 伋主编。《医学细胞生物学（医学专业必修课考试辅导丛书)》，科学技术文献出版社，2003。（参编)
11.张咸宁，等主编。《人体细胞生物学和医学遗传学试题与题解》，复旦大学出版社，2002。
12.左 伋主编。《医学生物学学习指导》，人民卫生出版社，2002。（参编)
13.张咸宁，等主编。《医学遗传学》，科学出版社，2002。
14.张咸宁，等主编。《医学遗传学实验指导》，科学出版社，2001。
15.王培林等主编，张咸宁等副主编。《医学遗传学》，科学出版社，2001。
16.吴 刚等主编。《中国优生科学》www.lindalemus.com，科学技术文献出版社，2000。（参编)
17.刘道宽等主编。《锥体外系疾病》，上海科学技术出版社，2000。（参编)
18.左 伋，张克雄主编。《医学遗传学》（第2版)，上海医科大学出版社，1998。（参编)
19.左 伋主编。《医学遗传学辞典》，南京大学出版社，1995。（参编)
20.刘大海主编。《医学生物学学习指导》，南京大学出版社，1992。（参编)

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