医疗实力: 拥有6个广东省医学重点专科， 广东省35项 “名医工程项目”我校占9项。有直属附属医院6所（南方医院、珠江医院、第三附属医院、江都医院、中西医结合医院和北滘医院)，其中第一临床医学院（南方医院)、第二临床医学院（珠江医院)都是高水平综合性教学医院，展开床位5000余张。在消化病诊治、肾病的综合治疗、中西医结合诊疗、肾肝移植、异体手移植、造血干细胞移植、心脑血管介入、创伤修复、新生儿重症救治和围产医学等方面形成了明显的特色优势。南方医院惠侨科被中央军委授予“模范医疗惠侨科”荣誉称号，并得到江泽民同志亲笔题词嘉勉。
产业开发: 自20世纪80年代以来，学校坚持以“科学技术是第一生产力”为指导思想，开创了全国高校产学研一体化先河，以自主研发的“三九胃泰”、“正天丸”、“无限极口服液”、 “尿毒清”等产品为基础，先后创建了深圳南方制药厂（三九集团前身)、南方李锦记营养保健品有限公司（现名无限极（中国)有限公司)、广州康臣药业有限公司等国际知名的医药企业。2004年转制地方以来，取得科技成果300余项，研制出国际上第一个SARS抗原检测试剂盒、国家1类新药全氟丙烷人血白蛋白微球注射剂、f-PAX系统等重量级的科研产品并成功转化，在生物医药、保健食品、医疗器械、日用化工等多个医药相关领域新建立了东方药林、南方洁灵、宜诚数字医疗等一批高新技术企业。
学校仪器设备精良，目前设备总值19亿多元人民币，其中A、B类设备达90%以上。有着良好的信息化教学环境，拥有装备现代的教学管理指挥中心和电化教学中心，基本实现形态学科实验显微录像化、机能学科实验微机化。教学场所齐全，教室基本实现了空调化、网络化及电子化。新建的4人一间的本科生公寓实现了通电话、 通网络、通电视，拥有人工草皮的足球场和塑胶跑道的田径场。图书资料丰富，图书馆藏书近253万册（含电子图书68万册)，电子期刊2.85万种，现刊约1000种。学校投资数千万元， 建成能连通因特网和中国教育科研网的校园网络、先进的光盘检索系统和卫星介导的图书数据库信息检索网络，实现了图书信息资源共享。
学校现有教学、科研、医疗及行政用房81.48万平方米；截止2009年12月31日，学校总资产75.53亿元，其中固定资产66.03亿元（按原始价统计，不含地产)，其中教医研设备总值18.9亿元，其中十万元以上的贵重仪器11.9亿。 建成了千兆级校园园区网络，所有教室和实验室实现了网络化、空调化、电子化。学生公寓可容纳1.6万名学生，并全部实现了通电话、通网络。 是军委确认的具有医学情报查新资格的院校之一。
院有包括PET–CT在内的医疗设备9000余台(件)，设备总值达7.9亿元，其中南方医院医疗设备总值4.9亿元。
1985年引进我国第1台，也是东南亚第1台核磁共振仪（MRI)（国内第2台是北京天坛医院)，出版了国内第1部MRI专著，制定了国内第1个MRI诊断标准。 影像中心是全省几十家中小医院的远程会诊中心，为全国七年制统编教材《医学影像学》的主编单位。
1999年全国首批、广东省首家引进PET，是广东省唯一能自己生产PET显像剂的单位，并供应省人民医院等医院。检查例数已达7300余例， 国内最多（第2位是上海华山医院)。
1997年引进华南地区第1套三维适形放疗系统（俗称“光子刀”)医学全在线搜集整理www.lindalemus.com，已治疗3000余例，居华南地区首位（第2家为中山医肿瘤医院，2001引进，例数约为2000余例)。
1999年10月引进了亚洲第1套氩氦刀治疗系统。
2002年引进国内第1套肿瘤光动力治疗系统，治疗各类肿瘤达200余例，为国内开展例数最多的单位。
学校是国务院首批批准的具有硕士学位授予权的单位，国务院第三批批准的具有博士学位授予权的单位。从1979年开始招收培养硕士研究生，1987年开始招收培养博士研究生。目前学校拥有10个博士学位授权一级学科，75个博士学位授权点，98个硕士学位授权点，我校医学门类博士学位授权一级学科数位居广东省第一，在全国独立设置的医科大学中，排名第二。形成了以医学为主体，理学、工学、法学、管理学、教育学等多学科协调发展的较为完整的学位授权体系。
学校现有3个国家重点学科：人体解剖与组织胚胎学、内科学（消化系病)、中西医结合临床；2个国家重点（培育)学科：病理学与病理生理学、外科学（骨外)；5个国家中医药管理局重点学科，10个广东省重点学科。学校以项目为纽带建设了五大学科群：用于疾病诊断的生物新技术研究、重大疾病的分子基础及药物筛选、器官衰竭的防治研究、应对核化生恐怖的医学防护技术研究、疑难病证中西医结合诊疗方案优化及新制剂研发，2008年，该五大学科群被广东省评为第三期“211工程”重点建设项目，获得建设经费逾亿元。
