目前，我院隶属于中国医药工业研究总院，是总院创新研发力量的最重要组成部分，主业为：创新药物及工艺的研发、技术经营和药学领域研究生教育。我院现有上海市抗感染药物研究重点实验室、化学制药部、生物制药部、中药制药部、上海呼吸系统药物工程技术研究中心、药理评价研究中心、化学制药新技术中心、分析测试中心等8个科研部门。包括国家科技部依托于我院设立的第一批企业国家重点实验室——“创新药物与制药工艺国家重点实验室”，并以“开放、流动、合作、竞争”的机制运行。
我院还拥有药学院1个，拥有博士点5个，硕士点7个，博士后流动站1个，系国家药学一级学科单位，先后为国内医药工业界培养博士、硕士500余人。
我院现有员工和在读研究生600余人，大部分为专业技术人员，包括：中国工程院院士2人，高级职称75人，中级职称99人。员工中研究生毕业131人。建院以来已有享受国务院特殊津贴专家79人。目前，我院技术创新团队的结构、素质进一步改善医学全在,线www.lindalemus.com，创造力、影响力不断显现，多位专家获得“国家级有突出贡献的中青年专家”等荣誉，以及入选国家“新世纪百千万人才工程”、“上海市领军人才”、“上海市浦江人才专家”培养计划。
我院在实现新跨越的过程中，正按照总院“一三四六”发展战略，在总院的领导下，确保“十一五”重大专项综合药物研发大平台及其他子平台的目标完成，要根据国家创新战略，提前谋划“十二五”重大专项综合药物研发大平台及子平台的组织申请，不断增强承担国家重大项目的能力，不断突破行业共性、关键性、前瞻性技术，巩固和强化研发优势。
正按照强化科研为目标，进一步完善科研组织架构体系，规划建设新的技术领域、技术平台，强化各学科综合协调发展，进一步提升能级，实现聚焦，以加快创新，继续坚持以专利战略推动创新药物、创新工艺研究，提高专利申请的含金量，加强自主知识产权的保护。
正按照组织浦东张江研发中心建设的规划，寻求硬件设施和科研仪器设备的投入，优化院资源配置，力争在硬件建设方面达到国内一流，全面与国际水平接轨，参与总院中试孵化基地的规划，以利于拓展延伸我院在化学药物、生物技术、制剂技术等领域的实验室研究工作，形成新增长点。
正按照主动融入总院和集团内部产学研一体化的发展格局的要求，完善对接机制，在现代制药新产品的开发和储备中加强合作，并根据集团工业板块发展所需要的重大品种技术需求，加强与集团内各生产企业的合作，培育新品种，开发新技术，为集团工业体系的快速发展做出贡献。
正按照体现国际医药研发合作交流平台的功能，多渠道、多形式地加强与国外知名医药企业以及医药研发机构的合作。从而为“十二五”开好头起好步，为未来五到十年内实现技术创新的跨越式突破，奠定扎实的基础，进一步为上海医工院的企业形象增色。有力地服务于集团产业基地建设，服务于集团产业结构调整的战略转型，服务于集团进入世界500强的宏伟蓝图。
上海医药工业研究院2013年硕士研究生招生简章
2013年全国硕士学位研究生招生简章
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