《治痢慈航》大约成书于清乾隆六十年（1795年)前后，有光绪十九年（1893年)吴锡纯重刻本和光绪二十四年（1898年)湖南常德府水星楼杨萃新药材行刊本。

吴氏本有作者熊家骥写于乾隆六十年的自序和吴锡纯、汪均镛作的两篇序；杨氏刊本前有清江丁绍松辅臣序，后附丰城杨氏喉科经验良方。

《治痢慈航》原名《痢疾奇方》，又名《痢疾特启论》。吴锡纯任清江县令重刊时才更名《治痢慈航》。全书一论十方。立论以肝木为主，选方以人参败毒和芍药甘草汤为主。

熊家骥自序说："痢疾一症，余独得神悟，故敢将先贤诸论，一概抹倒，独创新面。"熊氏理认认为痢疾在肝而不在于大肠，把痢疾分成两种类型： 一是痢疾初起，微有寒热，脉见沉弦，口中和，没有其它病因，就用人参败毒散，以挽回"肝陷"。轻微的，只需一二剂可望痊愈；如果不见效，而病者只是微热，就应以"和肝"为急务，宜用芍药甘草汤，加生姜、吴萸、木香。 二是腹中绞痛异常的。熊氏认为，这是"肝木受戕之甚"，急需用芍药汤，重加桔梗、祁艾、生姜、陈茶；如果小便不利，小腹疼痛，就要再加猪苓、泽泻、肉桂。

吴锡纯序云："癸已（即光绪十九年)夏六月，予调署清江。三伏酷热，均奔走烈日中。下车次日，初则霍乱吐泻，旋即变痢发热……红白交下，夜数十解，已岌岌自危。邑增生严博云秀才遵嘉言医治，不旬朝而获瘳。嗣邑绅杨少桐以《痢疾奇方》一书特赠，为熊兰亭所著，亦悉本于嘉言。"据清江县人民医院张连仁大夫说，熊家骥治痢虽本于喻嘉言，但却有新的发展，而以善用桔梗著称。

传说熊氏曾一次用桔梗半斤治臌胀，一服而愈，治法十分奇特。 熊家骥，号兰亭，清江樟树镇垣下村人，乾隆间举人，曾在四川一带为官。于公事之暇，他常为人治病施诊，并且以医药术驰名四川，在重庆有"药王"之称。