阿米巴病由溶组织的阿米巴原虫所致。其生活史中主要分为滋养体(大、小)和包囊二个阶段。滋养体是致病因子，对药物敏感。包囊是传播因子，是复发的根源，对药物不敏感。
(一)用于治疗肠内外阿米巴病的药物：
1、甲硝唑(甲硝基羟乙唑，灭滴灵)Metronidazole：对组织、肠腔内大滋养体有强大的杀灭作用。口服对肠内阿米巴痢疾和肠外阿米巴病如肝脓肿均有很好的疗效。可作为肝阿米巴脓肿的首选药。本品为高效杀滴虫药。本品口服配合霜剂可杀灭毛囊虫。对所有致病厌氧菌均有明显抗菌作用，包括大部分产黑色素类杆菌、梭形杆菌、梭状芽胞杆菌等。不良反应较少，主要是胃肠道反应。
2、依米丁(吐根碱)Emetine：作用特点：对组织中包括肠壁内的阿米巴大滋养体有强大杀灭作用。能迅速控制急性阿米巴痢疾症状。吸收后肝中浓度最高。故主要用于肝阿米巴脓肿、急性阿米巴痢疾及慢性阿米巴痢疾的急性发作等，给药后症状迅速消失。因不能杀灭小滋养体，不能根治。本品为原生质毒物，对各种组织都有损害作用，主要是心脏毒性；局部刺激性强；有胃肠道反应；对横纹肌有毒性反应。
3、其它：去氢依米丁Dehydroemetine、碘化铋依米丁、哌硝噻唑(硝噻唑)Piperanitrozole等。
(二)用于治疗肠内阿米巴病的药物：医.学.全.在.线www.lindalemus.com
  主要是杀灭或抑制肠内小滋养体，对包囊无杀灭作用，但可通过杀灭小滋养体达到清除包囊的效果。
1、卤化喹啉类：本类药有喹碘仿(安痢生，药特灵)Chiniofon、双碘喹啉Diodoquin、氯碘喹啉 Iodochlorohydroxyquin等。口服后在肠内可释放出碘，抑制大肠杆菌等共生菌群，使阿米巴小滋养体的营养(以细菌营养)供给缺乏，不能生长繁殖，产生间接杀灭小滋养体的作用。对包囊无杀灭作用，但可通过杀灭小滋养体达到清除包囊的效果，根治率很高。此类药在组织分布很少，对组织内大滋养体作用较差或无效，疗效慢。但根治率高，毒性低。主要用于轻型急、慢性阿米巴痢疾及无症状带虫者。用于治疗急性阿米巴痢疾与甲硝唑或依米丁合用，既可迅速控制急性症状，又可达到根治效果。不良反应主要是腹泻。
2、抗生素类：溶组织阿米巴小滋养体在肠道内必须获得大肠菌丛(特别是大肠杆菌)的代谢产物才能生长繁殖，四环素、土霉素、巴龙霉素、红霉素等能抑制这些菌丛生长，间接发挥抗阿米巴作用。用于治疗急慢性阿米巴痢疾疗效甚佳，根治率高，不良反应少，毒性低。但对肠外阿米巴无效。
3、卡巴胂Carbarsone：为5价胂，对肠腔内阿米巴小滋养体和阴道滴虫有直接杀灭作用。机理是与虫体酶系统巯基结合，使酶失活。口服吸收很少，肠腔内浓度高，可肃清肠内小滋养体，清除包囊，取得根治效果。复发率较低。主要用于慢性阿米巴痢疾和无症状带虫者。对急性阿米巴痢疾应先用甲硝唑或依米丁，待症状控制后再用本品。也可与抗生素合用。本品毒性较大，常见恶心、呕吐、腹泻等，也可引起肝肾组织坏死。
4、其它：阿的平Atebrine,Atabrine、鸦胆子、白头翁、大蒜等。
(三)治疗肠外阿米巴病药：
    氯喹Chloroquine：对阿米巴大滋养体有杀灭作用，仅次于依米丁。口服吸收完全，在肝中浓度极高，可超过血中浓度几百倍。故对肝阿米巴脓肿有很高疗效。对肺阿米巴脓肿亦有效。