公开(公告)号
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CN1930302A
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公开(公告)日
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2007.03.14
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申请(专利)号
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CN200380110979.8
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申请日期
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2003.12.09
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专利名称
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用于检测临床样品中的病原分枝杆菌的方法
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主分类号
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C12Q1/68(2006.01)I
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分类号
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C12Q1/68(2006.01)I
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分案原申请号
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优先权
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申请(专利权)人
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印度科学工业研究所
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发明(设计)人
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拉哈·哈里·达斯;阿贾伊·库马尔;梅格帕蒂·辛格
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地址
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印度新德里
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颁证日
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国际申请
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2003-12-09 PCT/IB2003/005767
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进入国家日期
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2006.07.07
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专利代理机构
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北京银龙知识产权代理有限公司
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代理人
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钟 晶
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国省代码
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印度;IN
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主权项
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检测临床样品中病原分枝杆菌的方法,所述方法包括以下步骤: a.通过常规方法净化临床样品,去除包括粘液的污染物, b.用改进的裂解缓冲液处理步骤(a)所得的经处理的临床样品以使活病原分枝杆菌失活,从而使过程对使用者安全, c.利用改进的方法,从步骤(b)所得的经处理的临床样品中提取基因组DNA,从而提高DNA的产量和质量, d.从步骤(c)所得的DNA设计用于检测病原分枝杆菌的序列SEQ ID No.4,所述设计的序列包括步骤(c)所得DNA所选出的SEQ ID No.3的基因间区域、含SEQ ID No.l的mmaAl基因部分的侧翼区域和SEQ ID No.2的mmaA2基因部分, e.设计并合成一套用于扩增SEQ ID No.4的反向引物的特异寡核苷酸引物,其中SEQ ID No.5的为正向引物,和SEQID No.6为用于聚合酶链式反应(PCR), f.开发用于特异性扩增(d)的SEQID No.4的PCR扩增过程,所述过程包括使用步骤(e)中设计并合成的特异性寡核苷酸引物,用于检测临床样品中病原分枝杆菌的存在,和 g.通过限制酶片断长度多态性(RFLP)分析PCR扩增产物,用于区分病原分枝杆菌菌种,用于快速评估HIV的共感染。
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摘要
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本发明涉及检测诸如痰、脑脊髓液、胃洗出物和组织活体检测物等临床样品中的病原分枝杆菌,其特征在于,利用设计的寡核苷酸引物对来延伸本发明的新DNA,所述寡核苷酸引物对能特异扩增来自于临床样品的靶DNA,所述DNA位于甲基分枝菌酸合成酶基因mmaA1和mmaA2之间的基因间区域以及mmaA1和mmaA2基因中的侧翼区域。
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国际公布
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2005-06-23 WO2005/056831 英
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