| 公开(公告)号 | CN1268765C |
| 公开(公告)日 | 2006.08.09 |
| 申请(专利)号 | CN02815270.0 |
| 申请日期 | 2002.06.28 |
| 专利名称 | 用于确定作为抗菌药物的D-ALA-D-ALA连接酶抑制剂的基于结构的药物设计方法 |
| 主分类号 | C12Q1/37(2006.01)I |
| 分类号 | C12Q1/37(2006.01)I |
| 分案原申请号 | |
| 优先权 | 2001.6.28 US 60/301,676 |
| 申请(专利权)人 | 医贤治疗学公司;普利瓦股份公司 |
| 发明(设计)人 | M·A·纳维亚;P·J·阿拉;J·P·格利菲斯;J·A·阿里;C·H·法尔曼;S·T·莫;A·S·马吉;P·R·康纳利;E·佩罗拉 |
| 地址 | 美国马萨诸塞州 |
| 颁证日 | |
| 国际申请 | 2002-06-28 PCT/US2002/020465 |
| 进入国家日期 | 2004.02.03 |
| 专利代理机构 | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 |
| 代理人 | 唐伟杰 |
| 国省代码 | 美国;US |
| 主权项 | 确定D-Ala-D-Ala连接酶的可能的抑制剂的方法，所述方法包括下列步骤： 使用依据附图8的限定大肠杆菌D-Ala-D-Ala连接酶的ATP结合口袋的氨基酸的原子坐标来产生大肠杆菌D-Ala-D-Ala连接酶结合口袋的三维结构，其中所述氨基酸选自Lys144、Glu180、Lys181、Leu183、Glu187、Asp257和Glu270，并且其位置与主链原子的均方根偏差不超过±10； 在所述三维结构和可能的抑制剂之间进行拟合操作；和 选择可能的抑制剂，所述抑制剂结合后诱导大肠杆菌D-Ala-D-Ala连接酶的B结构域向所述结合口袋进行刚体旋转。 |
| 摘要 | 本发明是基于下述发现：一些小分子可结合D-Ala-D-Ala连接酶的ATP结合位点，甚至在没有酶底物存在的情况下也是如此，并且可引起类似于在ATP和底物与酶结合时所发生的酶结构的构象改变。虽然不希望受敷于理论，但据信，这样的构象改变是激活或抑制酶所必需的。从该发现所获得的信息已使得能够鉴定酶活性位点中的关键相互作用，以及设计和优化抑制剂。 |
| 国际公布 | 2003-01-09 WO2003/002063 英 |
