公开(公告)号
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CN1263869C
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公开(公告)日
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2006.07.12
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申请(专利)号
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CN03111452.0
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申请日期
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2003.04.14
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专利名称
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病毒性肝炎集成诊断及耐药分析芯片及其制备工艺和使用方法
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主分类号
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C12Q1/68(2006.01)I
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分类号
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C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I
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分案原申请号
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优先权
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申请(专利权)人
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赵雨杰;何 群;侯伟健;马汝海;王绍成;张玉魁;潘忠诚;王天骄;马佳明
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发明(设计)人
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赵雨杰;何 群;侯伟健;张玉魁;王绍成;潘忠诚;王天骄;马佳明;马汝海
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地址
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110001辽宁省沈阳市和平区北二马路92号中国医科大学生物中心
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颁证日
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国际申请
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进入国家日期
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专利代理机构
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沈阳智龙专利事务所
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代理人
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宋铁军
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国省代码
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辽宁;21
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主权项
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一种病毒性肝炎集成诊断及耐药分析芯片,其特征在于:该芯片为玻璃基片上分布有多个不同区域的微阵列,在每个微阵列区域中,依次分别固定有甲、乙、丙、丁、戊、庚、TTV七种类型的病毒型肝炎及其常见亚型的探针;在该芯片的微阵列中,设有质控探针和多个乙肝耐药分析探针;探针的大小为15-20个碱基,设计75个探针,所设计的探针序列如下: 甲肝探针SequnceSeqNo.Genetype Probe1.15`-caaatgctatgttgtccactgagtc797HAV Probe1.25`-caaatgccatgttgtccactg797HAV 乙肝探针SeqNo. ProbeSequnce611Genetype acute,adr,adyw,carcin Probe2.15`-ATCCCATCATCCTGGGCTTT611oma,negtive, Probe2.25`-CCCATCATCTTTGGCTTTCG611anti-drug Probe2.35`-ATCCCATCGTCCTGGGCT611anti-drug,adw2 Probe2.45`-ATCCCATCATCTTGGGCTTTC611chronic,adw,wild Probe2.55`-ATCCCATCATCTTGGGGTTTC623ayw Probe2.65`-TGGGCTTTCGGAAAATTCC623adyw acute,adr,carcinoma,n Probe2.75`-TGGGCTTTCGCAAGATTCC623egtive, Probe2.85`-TTGGCTTTCGCAAGATTCCT623anti-drug anti-drug,adw,adw2,w Probe2.95`-TGGGCTTTCGCAAAATACCT623ild Probe2.105`-TGGGCTTTCGCAAAATTC656chronic,adw,wild Probe2.115`-TCAGCCCGTTTCTCTTGGC656adyw Probe2.125`-CAGCCCGTTTCTCCTGGC652carcinoma Probe2.135`-GGCCTCGGTCCGTTTCTCnegtive adr,carcinoma,adyw,chroni Probe2.145`-TGGTTCGTAGGGCTTTCCC701c,adw,adw2,wild,anti-drug Probe2.155`-AGTGGTTCGCAGGGCTTTC730acute,ayw,negtive acute,negtive,carcino ma,adyw,chronic,adw, Probe2.165`-GCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGT730wild Probe2.175`-CTTTCAGTTATATGGATGATCTGGTATT730ayw Probe2.185`-CTTTCAGCTATATGGATGATGTGGT730adw2 Probe2.195`-CTTTCAGTTATANGGATGACGTGG730anti-drug Probe2.205`-GCTTTCAGCTATATAGATGATGTGGTA769anti-drug Probe2.215`-TCTGTACAGCATCTTGAGTCCCTT769adyw acute,carcmoma,negti Probe2.225`-TCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTT769ve,ayw,adw,wild Probe2.235`-TCTGTGCAACATCTTGAGTCCC769chronic Probe2.245`-TCTGTACAGCATCGTGAGTCCC769adw2 Probe2.255`-TCTGTACAACATCTTGAATCCCTTT931adr Probe2.265`-CACAAAATCAAAGAATGTTTTAGAAAA931adyw Probe2.275`-TTAAAACTCAAACAATGTTTTCGGA931acute,negtive Probe2.285`-CTAAAACTCAAGCAATGTTTTCGAA931adr Probe2.295`-CTCAAAATTAAGCAATGTTTTCGAA931carcinoma Probe2.305`-CAAAAAATCAAAATGTGTTTTAGGAA931chronic Probe2.315`-CACAAACTCAAACACTGTTTTAGAAAA931ayw Probe2.315`-AGAAAAATCAAAATGTGTTTTAGGAAA931adw Probe2.325`-AGAAAAATCAAAATGTGTTTTAGGA931wild Probe2.335`-CAAAAGATCAAACACTGTTTTAGAAAAadw2 丙肝探针SequnceSeqNo.Genetype Probe3.15`-TGGTACTGCCTGATAGGGTGC272HCV Probe3.25`-TGGATCAACCCGCTCAATG187HCV 丁肝探针SequnceSeqNo.Genetype Probe4.15`-GAGCGCATCGCAGAGGG336Quebechdv Probe4.25`-GAGCGCATCGCGAGAGG336Venezuelahdv Probe4.35`-GGGGCGCATCGCGA336Acutehdv Probe4.45`-GAGCGCTCGGGTGGTAGG336Italyhdv probe4.55`-AGCTCTGACGCGCGAGG336TW2667 Probe4.65`-GACCCTGGTACCGGGGG336Venzuela Probe4.75`-AGGCGCTTCGAGCGGTA336C.A.P Probe4.85`-AGACTCTCTTCCCGGTGGGA336African Probe4.95`-GGCTCTCTCACGCGGTAGG336Smalian Probe4.105`-GAGCTCCCTCCTCCTCCTTC336TW2476 戊肝探针SequnceSeqNo.Genetype Probe5.15`-GGACCTCGTGTTCGCCAAC5363HDV Probe5.25`-GCCCTCGGCAGCCAAT5369Chinese Probe5.35`-CCTCGACAGCCGCCCC5372JRA1 Probe5.45′-GACCTCGCGTTCGCCAA5363Indian 庚肝探针SequnceSeqNo.Genetype Probe6.15`-AGCCCGTCACCCACCTG296Iowan.China Probe6.25`-GCCCGTAACCCGCCTG296Serum Probe6.35`-GCCCATTACCCACCTGGG296HGVCN Probe6.45`-AGCCCGTTACCCACCTGG296USA,PNF2161 Probe6.55`-TACGGTCCACGTCGCCC330HGV TTV探针SequnceSeqNo.Genetype Probe7.15`-AGCAACAACATGGGCATCATAC1560TTV Probe7.25`-AGCAACAACATGGGGATCATAC1560pTZVT416
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摘要
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本发明涉及医学体外诊断技术,具体地讲是一种基因芯片——病毒性肝炎集成诊断及耐药分析芯片及其制备工艺和使用方法。它是在玻璃基片上分布有多个不同区域的微阵列,在每个微阵列区域中,分别固定有甲、乙、丙、丁、戊、庚、TTV七种类型的肝炎病毒型及亚型的特异性探针,同时另设有质控探针和多个乙型肝炎耐药分析探针。利用相应探针与经扩增并加入荧光标记的肝炎病毒DNA或cDNA杂交,经扫描仪扫描芯片,并对杂交信号进行分析,获得有关信息。这种芯片能同时检测七种病毒性肝炎,并分析其亚型及耐药特性,具有诊断快速准确、特异性高、信息量大的特点,对临床诊断和流行病学筛查都有很大帮助。
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国际公布
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