公开(公告)号
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CN1289691C
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公开(公告)日
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2006.12.13
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申请(专利)号
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CN03113853.5
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申请日期
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2003.03.04
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专利名称
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病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法
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主分类号
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C12Q1/68(2006.01)I
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分类号
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C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I
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分案原申请号
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优先权
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申请(专利权)人
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中国人民解放军基因工程研究所
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发明(设计)人
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马文丽;郑文岭;石 嵘
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地址
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510515广东省广州市同和第一军医大学分子生物学研究所
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颁证日
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国际申请
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进入国家日期
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专利代理机构
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广州知友专利商标代理有限公司
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代理人
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邵毓琴
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国省代码
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广东;44
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主权项
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病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法,包括以下步骤:(1)玻片的准备;(2)探针准备:采用PCR扩增病原体全基因组的各个基因和特异性片段,探针长度从数百到数千碱基不等,浓度在0.25~0.5μg/μL;(3)芯片制备:采用基因芯片点样仪进行点样;(4)打印后处理;(5)样品的处理:在PCR扩增过程中,采用Cy5-dUTP进行掺入标记,在标记前或标记后采用Sau3A I进行限制性酶切,使获得片段长度在200~600bps之间;其中,标记dNTP的配制为:三种dNTP的摩尔终浓度与另一种欲用荧光标记物替代的dNTP的摩尔终浓度比为5∶3,而荧光标记物cy5-dUTP与和其竞争性掺入的dTTP的摩尔浓度比是1∶3;(6)杂交:2×杂交缓冲液的配方为60%甲酰胺、12×SSC、0.24%SDS;(7)杂交后清洗;(8)扫描检测。
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摘要
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本发明公开了一种病原微生物诊断型基因芯片的快速检测方法,包括以下步骤:(1)玻片的准备;(2)探针准备:采用PCR扩增病原体全基因组的各个基因和特异性片段,探针长度从数百到数千碱基不等,浓度在0.25~0.5μg/μL;(3)芯片制备:采用基因芯片点样仪进行点样;(4)打印后处理;(5)样品的处理:在PCR扩增过程中,Cy5-dUTP进行掺入标记,在标记前或标记后引入限制性酶切,使获得片段长度在200~600bps之间;(6)杂交:2×杂交明冲液的配方为60%甲酰胺、12×SSC、0.24%SDS;(7)杂交后清洗;(8)扫描检测。本发明具有标记效率高、杂交检测结果稳定、杂交时间大大病短等优点,可将杂交时间从传统的16~20小时缩短到10分钟,尤其适用于临床感染性疾病的诊断。
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国际公布
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