公开(公告)号
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CN1629318A
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公开(公告)日
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2005.06.22
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申请(专利)号
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CN200410043596.X
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申请日期
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2004.05.08
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专利名称
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严重急性呼吸综合征的流行病学检测的分子标记和方法
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主分类号
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C12Q1/68
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分类号
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C12Q1/68;C12Q1/04
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分案原申请号
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优先权
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2003.7.10 CN 03141517.2
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申请(专利权)人
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国家人类基因组南方研究中心;广东省疾病预防控制中心
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发明(设计)人
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赵国屏;林锦炎;宋怀东;郑焕英;王升跃;何剑峰;任双喜;鄢心革;李亦学;万卓越;孔祥银;许锐恒;郝沛;吴新伟;顾伯伟;侯金林;陈竺;闵军;缪有刚;徐军;傅刚;陆家海;张树义;王小宁;涂长春;王鸣
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地址
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201203上海市浦东新区张江高科技园区碧波路250号
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颁证日
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国际申请
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进入国家日期
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专利代理机构
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上海专利商标事务所有限公司
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代理人
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陶家蓉
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国省代码
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上海;31
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主权项
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一种检测SARS病毒的流行病阶段的方法,其特征在于,该方法包括步骤:检测SARS病毒的核酸序列,与Genbank登录号NC004718的序列对比,其中:a)序列中具有选自下组的突变,表明该病毒属于早期型SARS病毒:27883位起有29个碱基插入,27856-27910处53个碱基缺失,1206→C,9404→C,9479→C,17564→G,20840→A,21721→A,22222→C,23823→G,27827→C;b)序列中具有选自下组的突变,表明该病毒属于中期I型SARS病毒:1206→T,9404→T,9479→T,17564→G,20840→G,21721→A,22222→C,23823→T,27827→C;c)序列中具有选自下组的突变,表明该病毒属于中期II型SARS病毒:1206→T,9404→C,9479→T,17564→G,20840→G,21721→A,22222→C,23823→T,27827→C;d)序列中具有选自下组的突变,表明该病毒属于晚期型SARS病毒:1206→T,9404→T,9479→T,17564→T,20840→G,21721→G,22222→T,23823→T,27827→T;e)在流行中期病毒中存在散在发生的碱基变异:21721→G,22222→T,27827→C;21721→A,22222→T,27827→G。f)序列中具有选自下组的突变,表明该病毒属于早早期型SARS病毒:2759或2760→T,3584→G,4108→A,6295→T,25286→A,25341→A,25356→G,25508→A,25628→G,25693→A,22570→C,22930→G,23316-23317→TT;g)序列中具有选自下组的突变,表示该病毒属于果子狸病毒:22927-22928→GA或AA。
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摘要
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公开了一种检测SARS病毒的流行病阶段的方法,该方法包括步骤:检测SARS病毒的核酸序列,与SEQ ID NO:1的序列对比,其中不同的核苷酸突变可表示SARS病毒所处的不同流行阶段(果子狸、早早期、早期、中期I型、中期II型和晚期型)。本发明还公开了具有SEQ ID NO:1的序列并具有上述突变的SARS病毒核酸序列以及用于该方法的试剂盒。
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国际公布
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