YN87448病毒毒株全基因组序列及其克隆方法
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公开(公告)号
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CN1141390C
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公开(公告)日
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2004.03.10
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申请(专利)号
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CN98120694.8
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申请日期
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1998.10.27
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专利名称
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YN87448病毒毒株全基因组序列及其克隆方法
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主分类号
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C12N15/11
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分类号
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C12N15/11;C07H21/04
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分案原申请号
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优先权
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申请(专利权)人
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中国预防医学科学院病毒学研究所
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发明(设计)人
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梁国栋;周国林;李蕾;付士红
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地址
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100052 北京市宣武区迎新街100号
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颁证日
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2004.03.10
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国际申请
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进入国家日期
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专利代理机构
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北京北新智诚知识产权代理有限公司
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代理人
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郭佩兰
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国省代码
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北京;11
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主权项
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一种YN87448病毒毒株全基因组序列，其特征在于：其全长包括11717个核苷酸，不包括5’端的帽子结构、3’端的多聚核苷酸尾，序列如下：ATTGGCGGCGTAGTACACACTATTGAATTAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTACCATTGCGTTTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCATGTAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATCAAGGACCTCCGGACCGTACTTGATACACCGGATGCTGAAACGCCATCACTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTACTCCGTCATGCAGGACGTGTACATCAACGCTCCCGGAACTATTTACCACCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCATACAACACCAACTGGGCCGACGAAAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTCTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTTAAGCCCGGGTCACGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGCTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGTCCCGGGGTCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACATACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACCGATACAGTAAAAGGAGAACGGGTATCGTTCCCCGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGCATAATGGCCACGGATATCTCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATCGTCATTAACGGTAAGACTAACAGGAACACCAATACCATGCAAAATTACCTTCTGCCAATCATTGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCCAAGGAGCGCAAAGCAGATCTTGACAATGAAAAAATGCTGGGCACCAGAGAGCGCAAGCTTACATATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTGCACTCGTTCTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTCCCCATGTCATCCGTATGGACTACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAGGTGAAATTGGCATTACAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAAGTCCCGGAGGAATTAGTTATGGAGGCCAAGGCTGCTTTCGAGGATGCTCAGGAGGAATCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTCCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGTATCGAGGCAGCTGCGGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATCGGAGCAGCACTCGTCGAAACCCCGCGCGGTCATGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCGATCTCTGTGCTGAAGAACGCTAAACTCGCACCAGCACACCCGCTGGCAGACCAGGTTAAGATCATAACGCACTCCGGAAGATCAGGAAGGTATGCAGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAAGTGCTGTACCATGGCCAGAATTCTTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACGCTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAGCTGTACCATATTGCCATGCACGGTCCCGCTAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTCGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGATGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGACTTGTCCTTTCGGGAGAACTGACCAACCCGCCCTATCACGAACTAGCTCTTGAGGGACTGAAGACTCGACCCGCGGTCCCGTACAAGGTTGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCAGGATCGGGCAAGTCAGCTATCATCAAGTCAACTGTCACGGCACGTGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTACGGCTGAGGGGCATGCAGATCACGGCGAAGACAGTGGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTATGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCACTACTTGCCTTGATTGCAATCGTCAGACCCCGTAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCTAAGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAACCACCCTGAAAAAGACATATGTACCAAGACATTCTACAAGTTTATCTCCCGACGTTGCACACAGCCAGTCACGGCTATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAAATGAAAACCACAAACCCGTGCAAGAAGAACATCGAAATCGACATTACAGGGGCCACGAAGCCGAAGCCAGGGGACATCATCCTGACATGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAACTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAGGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACCAGAAAAGGAGTATATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCGCTGTACGCGATCACATCAGAGCATGTGAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTAGTATGGAAAACTTTACAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACGTACCTAAAGGAAATTTTCAGGCCACCATCGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCGATAAACAGTCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACTAACGTTTGCTGGGCGAAAGCACTGGAACCGATACTGGCCACGGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAGCTGTTCCCACAGTTTGCGGATGATAAACCACACTCGGCCATCTACGCCTTAGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGACTCGACAAGCGGACTGTTTTCCAAACAGAGCATCCCGTTAACGTACCATCCTGCCGACTCAGCGAGGCCAGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACACGCAAGTATGGGTACGATCACGCCGTTGCCGCCGAACTCTCCCGTAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAAGGCACACAGCTTGATTTGCAGACGGGCAGAACTAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACTTGGTCCCAGTGAACCGCAATCTCCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGCACAAGGAGAAACAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAGCCAGTTCAAACACCACTCCGTACTTGTGATCTCAGAGGAAAAAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGCGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAATATTGGAACTAAATACAGAAACCATCACTTTCAACAGTGCGAAGACCACGCGGCGACCTTGAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAACTGCCTTAACCCCGGAGGCACCCTCGTGGTGA
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摘要
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一种YN87448病毒毒株全基因组序列及其克隆方法，该克隆方法将全基因分1 5片段，用RT-PCR方法扩增相应cDNA，连入pGEM-T载体，利用通用引物测序，在病毒基因序旬扩增引物设计上，选择甲病毒保守区域的核苷酸序列设计引物，引物3’末端尽可能终止在简并密码子较少的氨基酸位置且最后一个碱基终止在氨基酸密码子的第二位碱基，本发明从分子水平阐明了本病毒与其他流行株的差异，对了解病毒的来源进化过程及分子流行病学有重要意义。也表明：它是预防辛德毕斯脑炎流行的最佳制备疫苗的候选株。
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国际公布
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