siRNA筛选系统的通用性绿色荧光蛋白融合靶基因表达载体
公开(公告)号
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CN101121939A
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公开(公告)日
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2008.02.13
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申请(专利)号
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CN200710017857.4
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申请日期
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2007.05.15
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专利名称
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siRNA筛选系统的通用性绿色荧光蛋白融合靶基因表达载体
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主分类号
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C12N15/65(2006.01)I
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分类号
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C12N15/65(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I
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分案原申请号
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优先权
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申请(专利权)人
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西安交通大学
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发明(设计)人
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黄 辰;许德晖;刘利英;宋土生
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地址
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710061陕西省西安市健康路1号
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颁证日
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国际申请
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进入国家日期
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专利代理机构
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西安通大专利代理有限责任公司
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代理人
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陈翠兰
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国省代码
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陕西;61
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主权项
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siRNA筛选系统的通用性绿色荧光蛋白融合靶基因表达载体,其特征在于,该载体以pEGFP-C1载体为基础,在1336-1363改造SSe8387I和NotI两个内切酶位点,其载体大小为4695bp,载体命名为pEGFP-RNAi,序列如下: 1 TAGTTATTAA TAGTAATCAA TTACGGGGTC ATTAGTTCAT AGCCCATATA TGGAGTTCCG 61 CGTTACATAA CTTACGGTAA ATGGCCCGCC TGGCTGACCG CCCAACGACC CCCGCCCATT 121 GACGTCAATA ATGACGTATG TTCCCATAGT AACGCCAATA GGGACTTTCC ATTGACGTCA 181 ATGGGTGGAG TATTTACGGT AAACTGCCCA CTTGGCAGTA CATCAAGTGT ATCATATGCC 241 AAGTACGCCC CCTATTGACG TCAATGACGG TAAATGGCCC GCCTGGCATT ATGCCCAGTA 301 CATGACCTTA TGGGACTTTC CTACTTGGCA GTACATCTAC GTATTAGTCA TCGCTATTAC 361 CATGGTGATG CGGTTTTGGC AGTACATCAA TGGGCGTGGA TAGCGGTTTG ACTCACGGGG 421 ATTTCCAAGT CTCCACCCCA TTGACGTCAA TGGGAGTTTG TTTTGGCACC AAAATCAACG 481 GGACTTTCCA AAATGTCGTA ACAACTCCGC CCCATTGACG CAAATGGGCG GTAGGCGTGT 541 ACGGTGGGAG GTCTATATAA GCAGAGCTGG TTTAGTGAAC CGTCAGATCC GCTAGCGCTA 601 CCGGTCGCCA CCATGGTGAG CAAGGGCGAG GAGCTGTTCA CCGGGGTGGT GCCCATCCTG 661 GTCGAGCTGG ACGGCGACGT AAACGGCCAC AAGTTCAGCG TGTCCGGCGA GGGCGAGGGC 721 GATGCCACCT ACGGCAAGCT GACCCTGAAG TTCATCTGCA CCACCGGCAA GCTGCCCGTG 781 CCCTGGCCCA CCCTCGTGAC CACCCTGACC TACGGCGTGC AGTGCTTCAG CCGCTACCCC 841 GACCACATGA AGCAGCACGA CTTCTTCAAG TCCGCCATGC CCGAAGGCTA CGTCCAGGAG 901 CGCACCATCT TCTTCAAGGA CGACGGCAAC TACAAGACCC GCGCCGAGGT GAAGTTCGAG 961 GGCGACACCC TGGTGAACCG CATCGAGCTG AAGGGCATCG ACTTCAAGGA GGACGGCAAC 1021 ATCCTGGGGC ACAAGCTGGA GTACAACTAC AACAGCCACA ACGTCTATAT CATGGCCGAC 1081 AAGCAGAAGA ACGGCATCAA GGTGAACTTC AAGATCCGCC ACAACATCGA GGACGGCAGC 1141 GTGCAGCTCG CCGACCACTA CCAGCAGAAC ACCCCCATCG GCGACGGCCC CGTGCTGCTG 1201 CCCGACAACC ACTACCTGAG CACCCAGTCC GCCCTGAGCA AAGACCCCAA CGAGAAGCGC 1261 GATCACATGG TCCTGCTGGA GTTCGTGACC GCCGCCGGGA TCACTCTCGG CATGGACGAG 1321 CTGTACAAGT CCGGACCTGC AGGGAATTCC TCGAGGCGGC CGCATTCTAG ATAACTGATC 1381 ATAATCAGCC ATACCACATT TGTAGAGGTT TTACTTGCTT TAAAAAACCT CCCACACCTC 1441 CCCCTGAACC TGAAACATAA AATGAATGCA ATTGTTGTTG TTAACTTGTT TATTGCAGCT 1501 TATAATGGTT ACAAATAAAG CAATAGCATC ACAAATTTCA CAAATAAAGC ATTTTTTTCA 1561 CTGCATTCTA GTTGTGGTTT GTCCAAACTC ATCAATGTAT CTTAACGCGT AAATTGTAAG 1621 CGTTAATATT TTGTTAAAAT TCGCGTTAAA TTTTTGTTAA ATCAGCTCAT TTTTTAACCA 1681 ATAGGCCGAA ATCGGCAAAA TCCCTTATAA ATCAAAAGAA TAGACCGAGA TAGGGTTGAG 1741 TGTTGTTCCA GTTTGGAACA AGAGTCCACT ATTAAAGAAC GTGGACTCCA ACGTCAAAGG 1801 GCGAAAAACC GTCTATCAGG GCGATGGCCC ACTACGTGAA CCATCACCCT AATCAAGTTT 1861 TTTGGGGTCG AGGTGCCGTA AAGCACTAAA TCGGAACCCT AAAGGGAGCC CCCGATTTAG 1921 AGCTTGACGG GGAAAGCCGG CGAACGTGGC GAGAAAGGAA GGGAAGAAAG CGAAAGGAGC 1981 GGGCGCTAGG GCGCTGGCAA GTGTAGCGGT CACGCTGCGC GTAACCACCA CACCCGCCGC 2041 GCTTAATGCG CCGCTACAGG GCGCGTCAGG TGGCACTTTT CGGGGAAATG TGCGCGGAAC 2101 CCCTATTTGT TTATTTTTCT AAATACATTC AAATATGTAT CCGCTCATGA GACAATAACC 2701 CCGGCTGTCA GCGCAGGGGC GCCCGGTTCT TTTTGTCAAG ACCGACCTGT CCGGTGCCCT 2761 GAATGAACTG CAAGACGAGG CAGCGCGGCT ATCGTGGCTG GCCACGACGG GCGTTCCTTG 2821 CGCAGCTGTG CTCGACGTTG TCACTGAAGC GGGAAGGGAC TGGCTGCTAT TGGGCGAAGT 2881 GCCGGGGCAG GATCTCCTGT CATCTCACCT TGCTCCTGCC GAGAAAGTAT CCATCATGGC 2941 TGATGCAATG CGGCGGCTGC ATACGCTTGA TCCGGCTACC TGCCCATTCG ACCACCAAGC 3001 GAAACATCGC ATCGAGCGAG CACGTACTCG GATGGAAGCC GGTCTTGTCG ATCAGGATGA 3061 TCTGGACGAA GAGCATCAGG GGCTCGCGCC AGCCGAACTG TTCGCCAGGC TCAAGGCGAG 3121 CATGCCCGAC GGCGAGGATC TCGTCGTGAC CCATGGCGAT GCCTGCTTGC CGAATATCAT 3181 GGTGGAAAAT GGCCGCTTTT CTGGATTCAT CGACTGTGGC CGGCTGGGTG TGGCGGACCG 3241 CTATCAGGAC ATAGCGTTGG CTACCCGTGA TATTGCTGAA GAGCTTGGCG GCGAATGGGC 3301 TGACCGCTTC CTCGTGCTTT ACGGTATCGC CGCTCCCGAT TCGCAGCGCA TCGCCTTCTA 3361 TCGCCTTCTT GACGAGTTCT TCTGAGCGGG ACTCTGGGGT TCGAAATGAC CGACCAAGCG 3421 ACGCCCAACC TGCCATCACG AGATTTCGAT TCCACCGCCG CCTTCTATGA AAGGTTGGGC 3481 TTCGGAATCG TTTTCCGGGA CGC
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摘要
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本发明公开了siRNA筛选系统的通用性绿色荧光蛋白融合靶基因表达载体,该载体以pEGFP-C1载体为基础,包括人巨细胞病毒CMV启动子,增强的绿色荧光蛋白基因EGFP,单纯疱疹病毒HSV胸苷激酶TK多腺苷酸化信号,SV40早期启动子组成元件,在1336-1363增加SSe8387I和NotI两个内切酶位点,其载体大小为4695bp,载体命名为pEGFP-RNAi。本发明通过检测荧光强度可以非常方便快速地鉴定相应siRNA序列的沉默效果,从而筛选出最有效的siRNA序列。
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国际公布
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