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郑州大学由原郑州大学、郑州工业大学、河南医科大学于2000年7月合并组建而成，是一所拥有理、工、医、文、史、哲、法、经、管、教育学等十大学科的教育部和河南省共建的国家“211工程”重点建设高校。
郑州大学药学院是在原河南医科大学药学系（1992年建立，1993年开始招收药学专业本科生）的基础上，与原郑州大学和郑州工业大学相关药学专业组建而成，是河南省第一个招收本科药学专业的药学院，现有药学和药物制剂两个专业，每年招收160名本科生。拥有药物化学，药物分析和药理学三个硕士学位点和药物合成化学(有机化学博士点)以及肿瘤病理(病理博士点)两个博士学科点研究方向，在校研究生近100人，同时还设有多种层次的成人教育，在校生近1000人。设有郑州大学新药研究开发中心。药物化学为河南省重点学科，药物化学学科为郑州大学“211工程”六个重点建设学科之一，郑州大学药学院为河南省执业药师培训基地。
药学院现有教师40余人，高级职称20余人，博士15人，其中有省级特聘教授1人、博士生导师3人、硕士生导师20人。这些年药学院为培养新世纪的创新药学人才，努力改革教学方法、改进教学手段，提高教学效果。先后获得省及校级教学成果奖多项，有多人次参加了高等教育出版社和中国医药科技出版社组织的制药工程专业及药学专业统编教材的编写。在教学取得一系列标志性成果的同时，药学院还先后承担了国家自然科学基金项目、国家863项目、国家自然科学基金对外交流与合作项目、河南省杰出人才基金项目、河南省杰出青年基金项目、河南省高校杰出人才科研创新基金项目、河南省医药卫生创新工程项目等多项；获省级科技成果二等奖、三等奖，厅级一、二等奖，国家发明专利等多项；在省部级以上刊物发表论文120篇。今年又新增由药物化学系刘宏民教授和杨华博士所主持的两项国家自然科学基金资助。
郑州大学新药开发研究中心的前身是成立的“郑州大学药物研研究组”，现有一支年龄、知识结构比较合理、研究经验比较丰富的教师队伍：其中教授9人，副教授、高级工程师7人、具有博士学位的研究人员15人、在读博士15人。
1982年，药物合成作为“有机化学”硕士点的一个重要研究方向开始招收硕士研究生1999年药物合成作为有机化学博士点的一个重要方向开始招收博士生。2002开始招收药物化学硕士研究生。
郑州大学新药研究开发中心是是我校整合从事药物研究相关力量而成的重要研究机构，受到国家、省政府和学校的大力支持。其开发的我国新药审评办法出台后国家批准的第一个二类新药盐酸氟桂嗪在国内产生了重要影响，在河南淅川制药厂投产后创产值2个多亿，利税超过1个亿，获国家科技进步三等奖。国家级新药都可喜、阿咪三嗪、罗巴欣、西替利嗪等获国家新药证书，盐酸倍他洛尔已获临床批文。 郑州大学药物研究所还先后开发了新药“脑益嗪”、“盐酸地芬诺酯”、“心律平”等以及“维脑路通合成新工艺”、“2-甲基-5-硝基咪唑合成新工艺”、“甲硝唑合成新工艺”、“3，4，5-三甲氧基苯甲醛合成新工艺”、“克林霉素磷酸酯合成新工艺”等多项新产品、新技术，在河南、河北、江苏、黑龙江、湖北、深圳、山西等省市应用，产生了巨大的社会效益和经济效益。同时研究中心还进行了大量的药物合成与筛选、药物分析方面的应用基础研究，合成各类新化合物上千个，目前进入临床前研究的候选化合物有三个，在国内外学术刊物上发表论文200余篇，申请发明专利４项。
药学院及新药开发研究中心拥有的仪器包括400兆超导核磁、高分辨质谱仪、红外光谱仪、气相色谱仪、荧光分光光度仪、高速冷冻离心机、高效液相色谱仪、高速逆流色谱仪、双波长飞点扫描仪、激光粒度测定仪等大型仪器。
近万平方米的药学院大楼在新区已基本完工，今天的药学院人将以培养一流的高素质人才、创造一流的科研成果、提供一流的社会服务为己任，把握机遇，务实创新，同心同德，奋发图强，为早日跻身国内一流的综合性、研究教学型药学院行列而努力奋斗。
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