研究生教育是高等教育的最高层次。目前我院研究生教育和全国一样，出现了规模扩大化、结构复杂化、质量评价分层化和管理专门化等一系列新特点。不仅给研究生教育带来了新机遇，也带来了新的挑战。
一、研究生教育体系
目前，我院为基础医学一级学科博士学位授权点和一级学科硕士学位授权点、基础医学博士后流动站。基础医学一级学科博士点涵盖了我院现有的病理学与病理生理学、人体解剖学与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、法医学、放射医学等6个二级学科。硕士学位授权点除上述专业外，还有生理学、神经生物学、生物化学与分子生物学、药理学、医学遗传学等。目前我院已形成博士、硕士、专业学位、同等学力人员申请硕士学位等多层次、多类型的学位与研究生教育体系。
二、导师队伍与研究生教育规模
目前我院有教授、副教授50人，高级实验师17人，博士生导师9人，硕士生导师65人（包括外聘导师)，享受政府特殊津贴专家2人，特聘教授4人。在读博士生60余人，在读硕士生210余人。
三、基础设施
我院现有12个教研室，3个教学实验中心，12个研究所，1个河南省分子医学重点实验室，1个河南省肿瘤病理重点实验室，1个国家药品临床研究基地。基础设施完备，仪器设备先进，为研究生教育搭建了平台、提供了广阔的发展空间。
