基础医学院原名为基础部，始建于1952年，1996年更名为基础医学院。她是基础医学教育的重要基地，也是医学基础理论研究的中心。学院下设13个教研室（解剖学教研室、组织胚胎学教研室、生物教研室、生理学教研室、生物化学教研室、微生物学教研室、寄生虫学教研室、微生态学教研室、免疫学教研室、病理学与法医学教研室、病理生理学教研室、卫生学教研室、外语教研室；1个校院共管的中心实验室（辽宁省细胞分子生物学重点实验室)，5个学院二级实验室：机能学实验室，形态学实验室，生物化学与分子生物学实验室，病原学实验室，食品质量与安全实验室。
学院现有教职工206人，其中教授34人，副教授41人，讲师及助教62人，实验技术人员60人，行政办公人员5人，辅导员4人。现有学生988人（在校学习期间的前三年在我院)，包括临床医学专894人（临床医学661人，眼视光学64人，肿瘤学65人，运动医学43人，食品质量与安全61人)、生物技术专业62人及麻醉学专业32人。
学院有4个二级学科博士授权点（生理学、病理学与病理生理学、生物化学与分子生物学、人体解剖与组织胚胎学)，2个一级学科硕士点（生物学、基础医学)，十四个二级学科硕士点（神经生物学、发育生物学、生物化学与分子生物学、人体解剖与组织胚胎学、生理学、微生物学、医学遗传学、细胞生物学、病原生物学、病理学与病理生理学、劳动卫生与环境卫生学、免疫学、法医学、运动医学)，共有博士生导师21人，硕士生导师59人。
学院承担七年制、英文班、研究生、本科生、成人教育和留学生等多层次教学任务，并在全国率先进行了机能学实验教学的改革，目前正在进行的是神经科学教学改革，这将基础医学学科及基础与临床学科之间的课程整合为特点的大规模教学改革打下基础。
学院近三年来承担包括国家自然科学基金在内的各级课题80余项；在各级国际刊物上发表学术论文60篇，在国内专业期刊上发表论文830篇，获国家、省部和市级科研成果20项，获国家、省级优秀教学成果奖6项。
基础医学院办公室地址：大连医科大学第二教学大楼一楼
邮政编码：116027
基础医学院办公室电话：0411-84720063
E-mail：bmc@dlmedu.edu.cn
硕士授权点
解剖学： 陈要武 隋鸿锦 徐飞 王滨 马坚妹
生理学： 孙长凯 张万琴 邹原 姜春玲 高溪 李韶 李爱萍 孙艺平
生物化学： 赵宝昌 崔秀云 燕秋 张嘉宁 辛毅 马郁芳 刘佳 马克里 林琳 徐跃飞 濮良忠 邹向阳
组织学与胚胎学： 孔力 邵淑娟 初海鹰
病理学： 唐建武 李宏 吕申 李连宏 孙雷 王丽芬 关宏伟 王承芳
卫生学： 仲来福 朴丰源 戴红
寄生虫学： 崔昱
病理生理学： 贾玉杰 施广霞 邢嵘 李墨林
微生物学： 黄敏 范晓磊 唐立 袁杰力
基础免疫： 李芳 程桂芝 李建远
运动医学： 吕国枫
（学科后所列为相关学科导师)
