中医临床基础学科（国家中医药管理局、江苏省级重点学科)
南京中医药大学临床基础学科是由原有的温病重点学科和《伤寒论》重点学科，结合《金匮要略》学科和附属医院急诊中心而组成，其中包括了基础医学院的温病学教研室、《伤寒论》教研室、《金匮要略》教研室、微生物寄生虫教研室、医用生物学教研室、附属医院急诊中心等科室和部门。该学科原有的温病学和《伤寒论》学科是在八十年代初确立的博士学位授予点，《金匮要略》学科也是1986年确定的硕士学位授予点，因而这三个学科都具有较强的实力，而学科点组成部分的附属医院急诊中心则是全国中医急诊研究的中心，具有较强的实力。
学科梯队
学科点总人数：33人，其中： 教授（或主任医师)：11人； 副教授（或副主任医师)：13人； 讲师（或主治医师)：9人； 助教或实验员：3人； 博士生导师：6人；硕士生导师：12人; 获博士学位者：9人； 硕士学位者：11人。
年龄情况： 56～65岁：8人；51～55岁：4人；41～50：7人；31～40岁：13人；30以下：3人。从以上统计可以看出，本学科的梯队结构较为合理，中青年人员所占比例较多，后劲较足。
在本学科点中，有王灿晖、杨进、王兴华、符为民、杨廷光等人获得国务院政府特殊津贴，加上已退休的孟澍江、沈凤阁、陈亦人，共有8人获国务院政府特殊津贴，另有3人获得江苏省有突出贡献中青年专家称号。
科研情况
自1994年以来，中医临床基础学科承担了50余项科研课题，其中国家级4项，部级24项。其中有21项通过了鉴定。科研项目有了明显增加。 科研经费近年来也有了大幅度提高，1994年以来大约获各项科研经费250余万元。现在学科点副高职称以上人员年均科研经费为2.4万元。
近年来，本学科点的科研的内容亦逐步从纯理论和纯实验研究向实用方向发展，除了进行动物模型研制和治法机理研究外，还研制了多种治疗临床常见病、多发病的中药制剂，如加减三甲散、“肺毒清冲剂”、夏季感冒冲剂、菖欢冲剂、口康宁咀嚼片、急胰宁冲剂、通脑灵冲剂、胃血宁冲剂、脑络通冲剂等，分别对病毒性发热、糖尿病微血管损害、老年性痴呆、抑郁性神经症、口腔肿痛、急性胰腺炎、急性胃出血等疾病的中医药治疗进行了研究。目前这些药物已在多所医院进行临床验证，取得了较好的效果。
学科点科研论文被Index medicus, CA,BA,Medline引用8篇，国际会议交流14篇。本学科点的科研成果“肺毒清”治疗肺部病毒性感染的作用机理及临床研究已转让给南京医学医药集团生命能研究所，获转让经费22万元。
本学科教师主持的科研研究课题在1993年以前只获得2次厅局级奖，而从1994年以来获奖大大增加，其中获得国家中医药管理局基础研究三等奖一项、省科委科技进步三等奖一次，省教委科技进步二等奖二项、三等奖二项、江苏省中医管理局科技进步一等奖一项、校级科技进步奖二项。另外，有本学科教师参加的科研成果获国家科技进步三等奖、江苏省科技进步三等奖和江苏省中医管理局科技进步一等奖等。
具体获奖项目如下：
1、养阴生津法治疗热毒血瘀证的机理研究，主持人：杨进，国家自然科学基金，获南京中医药大学优秀科技成果奖。
2、热性病热毒血瘀证系列动物模型及其治法的研究，主持人：杨进，省教委。获1995年江苏省中医药管理局科技进步一等奖、1996年国家中医药管理局基础研究三等奖。
3、清热化瘀益气法治疗温病营血分证系列研究，与福建中医学院合作，福建省科委课题，获福建省政府科技进步三等奖，完成其中的血液流变学动物实验。
4、表证动物模型和解表泄热法的机理研究，主持人：杨进，省科委，获1996年江苏省教育委员会科技进步二等奖。
5、抗戾散治疗病毒性高热的临床与实验研究，与上海中医药大学合作，上海市科委课题，经费2万元，已完成鉴定，并获上海市人民政府科技进步三等奖。
6、中药马钱子炮制机理研究（参加)，国家教委，获国家科委科技进步三等奖。承担其中有关血液流变学方面的测试。
7、人参及人参皂甙与肿瘤坏死因子联合抗癌的实验研究，主持人：陆平成，江苏省教委，获得省教委９６年科技进步三等奖 医.学.全.在.线网站www.lindalemus.com
8、润喉开音片治疗慢性喉炎、声带小结的临床和实验研究（参加)，江苏省中管局，获江苏省中医药管理局1998年科技进步一等奖。
9、明党参的化学成份和药理研究（参加)，主持人：陈建伟，江苏省教委，获９５年省中医药管理局２等奖，96年国家中管局中医药基础研究三等奖。
10、中药抗突变研究，主持人：宋为民，江苏省教委，经费1万元，获得1996年江苏省教委科技进步奖二等奖。
11、胃血宁口服液治疗胃十二指肠溃疡的研究，国家中医药管理局，主持人：符为民，获江苏省科委科技进步三等奖。
另外，本学科点有一批专业人员因在科研工作中作出了贡献而获奖。自1994年以来，本学科点有3 人（杨进、马健、王兴华)被评为江苏省有突出贡献的中青年专家，5人（王灿晖、符为民、杨廷光、杨进、王兴华)获国务院特殊津贴。2人（陆平成、杨进)被评为学校“科技之星”。
