药学系现设本科药学专业、药物化学及药理学硕士点和药理学博士点。从创建伊始药学系的一切工作都围绕一流学科建设展开。目前药物化学是上海市教委重点学科，药学系还设有临床药理研究中心和药效学、药动学研究室等。药学系教师在完成教学任务的同时，积极开展科研工作。近年来，在肿瘤靶向治疗，神经营养和神经保护作用中药药理等方面开展了重点研究。目前承担了国家、教育部、上海市等各类科研课题二十余项。医学 全在.线提供www.med126.com
药学系2005每年招收本科生30名，研究生8名（其中博士生4名)。本科生的培养方向为药学。本科生的培养目标为培养德、智、体全面发展的具有现代药学理论、基本知识和技能的药学专门人才。本科教学以采用法语教学为特色，教学中培养学生的创新意识和适应先进技术的能力，使学生能在药物的生产、检验、流通、使用、研制和开发领域从事药物的设计、研发、制剂和临床合理用药等工作，也能够从事药学的教学、科研和管理工作。为了提高学生运用法语的能力，第一学年的课程设置强化法语教学，部分专业课程聘请外方教师主讲。
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