一、校本部：
1、基础医学院
2、第一临床医学院
3、肿瘤医学院
4、口腔医学院
5、公共卫生医学院
6、药学院
7、社科部
二、非直属附属医院及挂靠单位：
1、第三临床医学院：广西医科大学第三附属医院(南宁市第二人民医院、南宁120急救医疗中心)始建于1952年，是一所集医疗、急救、教学、科研、预防、保健、康复为一体的大型综合性医院，1993年起成为广西医科大学第三附属医院。医院是南宁市级首家三级甲等医院，全国百佳医院，全国卫生文明先进集体，全国百姓放心医院，全国卫生文化建设先进单位，全国模范职工之家，全国行业作风建设先进单位。
2、第四临床医学院：广西医科大学第四附属医院暨柳州市工人医院是一所集医疗、预防、保健、科研、教学为一体的国家三级甲等医院、全国首批"百姓放心医院"、卫生部国际紧急救援中心网络医院、广西十佳医院、国家爱婴医院和120急救定点医院。医院建筑面积14.7万平方米，业务用房约6.3万平方米。
3、第五临床医学院：柳州市人民医院创建于1926年，是广西医科大学第五临床医学院、第五附属医院，是全国百佳医院、全国百姓放心示范医院、卫生部国际紧急救援中心网络医院、国家爱婴医院、柳州市120急救中心所在医院，是广西市级医院中规模最大、专业设置最齐全、设备最先进、设施最完善，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性三级甲等医院。医学 全在.线提供www.med126.com
4、第六临床医学院：玉林市第一人民医院坐落于玉林市中心，交通方便，是桂东南最大的一所集医疗、科研教学为一体的综合性医院。属卫生部核定的全国 500家最大的综合性医院之一。1996年被世界卫生组织联合国儿童基金会中国卫生部授予“爱婴医院”，1999年获三级甲等医院、高等医学院校医院。
5、第七临床医学院：梧州市工人医院位于广西东部桂江、浔江交汇的美丽的鸳鸯江畔，始建于1903年4月。1986年首批被授予广西“文明医院”称号，是自治区和梧州市“双文明建设先进单位”，国家卫生部授予“爱婴医院”称号，2000年经评审确认为国家“三级甲等医院”，该院是广西卫生厅、教育厅确认的高等医学院校A级教学医院和自治区级继续医学教育培训基地。
6、第八临床医学院：贵港市人民医院始建于1938年，担负着全市450万民众的医疗、预防、保健、康复和急救任务，先后通过国家三级甲等综合性医院和A级教学医院的评审，成为是贵港地区唯一一家具有较高技术水平、学术水平、教学科研水平和科学管理水平及后勤保障能力的大型高等级综合性医院．2000年经评审确认为国家三级甲等综合性医院；2001年经广西卫生厅、教育厅确认为广西高等医学院校A级教学医院；2003年成为广西医科大学第八临床医学院、第八附属医院。
7、第九临床医学院：北海市人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、急救等功能为一体的国家三级甲等综合性医院，是广西医科大学第九附属医院第九临床医学院，是国家爱婴医院和卫生部国际紧急救援中心网络医院，是广东医学院、桂林医学院、右江民族医学院的教学医院，是北海市公共卫生突发事件应急救援中心，北海市人民政府指定的涉外医疗机构。是目前北海市医疗专业人员最多、专业最齐全、医疗技术水平最高的医疗中心
8、右江民族医学院：右江民族医学院是一所广西壮族自治区属全日制普通高等医科院校，位于滇、黔、桂三省（区）交界的大西南出海通道枢纽、风景秀丽的百色市。这里是邓小平同志领导的著名的百色起义的发源地。学院始创于1958年，前身为广西百色医学专科学校，1978年经国家教育部批准升格为本科医学院校，1982年获学士学位授予权。
9、四川省肿瘤医院：四川省肿瘤医院、肿瘤研究所暨四川省第二人民医院毗邻成都市火车南站，是周恩来总理生前关怀下筹建的重点省级医院。医院1994年通过国家“三级甲等”医院的评审。1995~2002年医院先后获成都市“文明单位”、“园林式单位”、“文明单位标兵”，获“四川省十佳城市医院”、“省级文明单位”、“四川省先进单位”、“省级最佳文明单位”等殊荣。
10、广西壮族自治区人民医院：广西壮族自治区人民医院位于南宁市风景秀丽的邕江之滨，南湖之畔。始建于1941年，经几代人不懈努力，现已发展成为一所以医疗为主，兼有科研、教学和预防保健为一体的大型综合性省级三级甲等医院，是广西的医疗中心。医院设有一个分院、两个门诊部和附属卫校。医院总占地面积22.94万平方米，建筑面积21.85万平方米，其中医疗建筑面积129500.81万平方米。现有临床、医技科室56个、1个广西重点学科、2个广西重点建设学科、14个省级医疗中心和9个院级重点学科。在职正式职工2456人，其中卫生技术人员2162人，高级卫技人员383人，博士、硕士264人，现有床位1390张，年门诊量130多万人次，住院病人3万多人次。