注重临床科学研究。获得国家科技进步奖23项、省部级科研奖140余项。近五年来承担国家级科研课题177项、省部级科研课题151项
www.lindalemus.com，其中国家自然科学基金资助131项；在国内外发表学术论文7500余篇。医院设有国内领先的中心实验室、临床药理中心、实验动物中心和卫生部内分泌重点实验室。正在筹建国家级临床重点实验室。2010年，协和转化医学中心成立，《协和医学》杂志创刊。
医院承担着国家重大会议、活动、赛事及特殊任务的医疗保障工作，重大突发事件的医疗救援及外国元首访华的医疗保健任务。近年来，在北京奥运、建国60周年庆典、抗震救灾、抗洪抢险中均表现出色，凸显了协和作为国家医疗队主要成员的重要作用。在2008年北京奥运工作中荣获“特别贡献奖”，为国争光。
医院重视管理，注重实效，积极探索可持续发展之路。精简机构，改革干部管理机制，实行公开竞聘和聘期目标责任制，定期考核、轮转、培训干部，形成了一支精干、高效的管理团队。院领导班子高度重视人才培养工作，特别是青年队伍建设，设立了中青年“百人计划”等培养项目，选派青年骨干出国学习；成立了住院医师管理委员会，由住院医师直接参与自身的培养管理工作；成立了国际合作智库（PICT)，发现、培养国际交流人才。
医疗服务质量是医院的永恒主题。医院始终将确保医疗质量、医疗安全和提升医疗服务水平放在各项工作之首，建立了院科两级的“全质控体系”，创新性地开展不良事件和病人安全隐患报告及手术安全核对工作，于2010年顺利通过ISO9001质量管理体系认证。
近年来，医院大力推进信息化建设工作，探索医院信息化建设新途径。与
石化盈科合作开展医院信息化建设，整合人员，转换职能，全面规划。加强信息系统灾备建设
www.lindalemus.com，承担了保健基地信息系统和新HIS建设重任。与微软公司合作建立信息系统平台，实现了病人信息资源共享。力争建成国际一流的数字化医院。
医院高度重视文化建设，传播、传承、发展协和文化。2011年7月，总结协和90年的发展经验，创新性提出了“待病人如亲人，提高病人满意度；待同事如家人，提高员工幸福感”新办院理念。
医院赢得了广大同行的认可和社会及病人的信赖，先后荣获百余项国家级、北京市级奖项和荣誉，每年接待数十批同行单位的大规模参观学习。荣获卫生部“2005-2007年度全国医院管理年活动先进单位”和“全国卫生系统护士岗位技能竞赛金奖”，被评为卫生部2010年优质护理服务考核优秀医院。
90年来，协和人以执着的医志、高尚的医德、精湛的医术和严谨的学风书写了辉煌的历史，今天的协和人正为打造“国际知名、国内一流”医院的目标而继续努力。
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