学校在完成各层次教学任务的同时，还承担了国家重点科研和攻关项目近70余项，国家自然科学基金科研项目、国家新药研究基金科研项目以及国家、省、市下达的科研任务300多项，不少项目达到国际先进水平，许多项目填补了国内空白。学校先后获得省、部级以上奖励的科技成果有55项，其中由中国科学院院士徐国钧教授主持的“常用中药材品种整理和质量研究”荣获国家科技进步一等奖。“九五”以来已获得国家卫生部颁发的新药证书70多本，一类新药证书10余本，专利70多项，同时涌现出一批具有较高水平的科研成果。
中国药科大学正在寻求教育、科技主动适应社会主义市场经济的机制，目前已与国内许多大型医药企业建立长期合作的关系。学校依靠自身的人才、技术优势，先后兴办了高科技企业11个，成立了中国药科大学科技实业（集团)总公司。学校积极开展横向联合，多方位与企业进行合作，有重点地开展高新技术开发。近年来，由科技开发转化生产的科技项目多达100余项，一大批科研成果已转化为生产力，在促进医药工业发展过程中发挥了重要作用。
在国际学术交流方面，中国药科大学先后与日本、美国、英国、意大利、澳大利亚、香港等多个国家和地区的23所学校签订了校际学术交流协议，还同罗马尼亚、南斯拉夫、瑞典、加拿大、香港、澳门等30多个国家和地区的多所院校及科研机构有学术上的联系。
中国药科大学是一所历史悠久而又充满活力的学校，目前正积极探索高等药学教育、教学改革，努力在教育质量、科学研究和管理水平上能够成为跻身于世界先进行列的多科性大学。
