2006年首都医科大学计划招收硕士研究生540人，报名参加我校硕士研究生选拔的考生共有2555人。根据教育部复试分数线及“进入复试的考生人数应占计划人数的120％”的文件精神，学校研究生招生工作组依据我校考生的成绩情况研究确定2006年我校复试分数线：
   1、教育学[应用心理学040230]（总分：325，英语：53，政治：53，综合：80，专业基础：90)
   2、医科类专业※(不含中医学[1005]、药学[1007]、中药学[1008])（总分：310，英语：50，政治：50，综合：75，专业基础：90)
   3、中医学[1005]（总分：300，英语：46，政治：46，综合：69，专业基础：90)
   4、药学[1007]、中药学[1008]（总分：310，英语：48，政治：48，综合：72，专业基础：90)
   5、管理学[社会医学与卫生事业管理  120402]（总分：340，英语：54，政治：54，综合：81，专业基础：90)
   注：医科类专业包括：基础医学、临床医学、口腔医学和预防医学等一级学科中的各专；生物学一级学科中的生理学、神经生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学和生物物理学；工学门类中的生物医学工程专业