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这是检查细菌性疾病常用的方法，也可对球虫病和其它寄生虫病作出诊断。
1．涂片镜检
用病料涂片，不经染色，直接镜检，可用于曲霉菌病、球虫病和其它寄生虫病的诊断。诊断曲霉菌病时，直接取肺和气囊上的结节，置载玻片上，用另一载玻片将结节压碎后，抹片，可以直接在低倍镜下观察有无菌丝和孢子；诊断球虫病时，刮取带血的肠内容物少许置载玻片上，涂一薄层，加一滴干净水于低倍镜下观察有无卵囊和裂殖体；诊断隐孢子虫病时，可以直接取呼吸道、法氏囊等内容物抹片，镜检可见到大量的隐孢子虫体。
2．涂片染色镜检
通过用病料涂片、染色和镜检，可以对细菌性疾病作出初步诊断，如鸡霍乱、葡萄球菌病等。用消毒过的剪刀取一小块病理组织，在洁净的载玻片上轻触一下，制成触片或轻抹一下制成抹片，凉干后，在酒精灯火焰上来回通过3～4次，进行固定，然后再经美蓝或瑞氏染液，在油镜下观察。如见到大量两极浓染的短杆菌，则为鸡霍乱；如见到大量成堆的球菌，则为葡萄球菌病。
3．常用的染色方法及染液配制
常用的细菌染色方法主要有两种类型，一是简单染色法，只应用一种染料进行染色的方法，如美蓝染色法；二是复染色法，应用两种或两种以上的染料或再加媒染剂进行染色的方法。染色时，有些是将染料分别先后使用，有些则同时混合使用，染色后不同的细菌和物体，或者细菌构造的不同部分可以呈现不同的颜色，有鉴别细菌的作用，又可称为鉴别染色，如革兰氏染色法、抗酸性染色法、瑞特氏染色法和姬姆萨染色法等。
(1)美蓝染色法
在干燥、固定好的抹片上，滴加适量的美蓝染色液，以足够覆盖涂抹点为好，经1～2分钟，水洗，用吸水纸吸干或自然干燥，但不能烤干，镜检。
碱性美蓝(亦称骆氏美蓝)染色液的配制：美蓝1．48克溶于100毫升95％酒精中制成美蓝饱和酒精溶液，取其30毫升，加入0．01％氢氧化钾水溶液100毫升，混合即成。此染色液密闭保存，可多年不坏。
(2)革兰氏染色法
在已干燥、固定好的抹片上，滴加草酸铵结晶紫染色液，经1～2分钟，水洗；加革兰氏碘溶液于抹片上媒染，作用1～3分钟，水洗；加95％酒精于抹片上脱色，约30～60秒，水洗，加稀释石炭酸复红(或沙黄水溶液)复染10～30秒，水洗；吸干或自然干燥，镜检。革兰氏阳性菌呈蓝紫色，革兰氏阴性菌呈红色。
草酸铵结晶紫(亦称赫克氏结晶紫)染色液的配制：结晶紫13．87克溶于100毫升95％酒精中制成结晶紫饱和酒精溶液，取其2毫升，加蒸馏水18毫升稀释10倍，再加入1％草酸铵水溶液80毫升，混合过滤即成。
革兰氏碘溶液的配制：将碘化钾2克置乳钵中，加蒸馏水约5毫升，使之完全溶解，再加入碘片1克，予以研磨，并徐徐加水，至完全溶解，然后注入瓶中，补加蒸馏水至全量为300毫升即成。此液可保存半年以上，当产生沉淀或褪色后即不能再用。
沙黄水溶液的配制：沙黄3．41克溶于100毫升95％酒精中制成沙黄饱和酒精溶液，将其用蒸馏水稀释10倍即成。此液保存期以不超过4个月为宜。
石炭酸复红染色液的配制：取3％复红酒精溶液10毫升，加入5％石炭酸水溶液90毫升，混合过滤即成。
(3)抗酸性染色法
萋－尼(Ziehl—Neelsen)氏抗酸性染色法：首先在已干燥、固定好的抹片上，滴加较多量的石炭酸复红染色液，在玻片下以酒精灯火焰微微加热至发生蒸气为度(不要煮沸)，微微发生蒸气持续3～5分钟，水洗。然后用3％盐酸酒精(加浓盐酸3毫升于95％酒精97毫升中即成)脱色，至标本五色脱出为止，充分水洗。再用碱性美蓝染液复染约1分钟，水洗。最后吸干，镜检，抗酸性细菌呈红色，非抗酸性细菌呈蓝色。
抗酸性染色法之二：在固定后的抹片上滴加金永(Kinyoun)氏石炭酸复红液，染3分钟。然后连续水洗90秒，再滴加加鲍脱(Gabbott)氏复染液复染1分钟。连续水洗1分钟，吸干，镜检。抗酸性菌呈红色，其它菌呈蓝色。①金永氏石炭酸复红液的配制：将碱性复红4克溶于95％乙醇20毫升中，缓缓加入蒸馏水100毫升并振摇，再加入石炭酸(化学纯)9毫升，混合；②加鲍脱氏复染液的配制：先将美蓝1克溶于无水乙醇20毫升中，加蒸馏水50毫升，再加浓硫酸20毫升即成。
抗酸性染色法之三：滴加石炭酸复红液于已干燥固定好的抹片上，染色1分钟，水洗。再滴加1％美蓝酒精溶液复染20秒，水洗，干燥，镜检。抗酸性菌呈红色。
www.lindalemus.com//www.lindalemus.com/shouyi/tu/wenda/ 镜检前对光检查染色片，标本务必全呈蓝色，如标本呈红色或棕色表明复染不足，应再做复染5～10秒钟，再观察，如仍未全呈蓝色时，仍可反复复染，至符合要求为止。
(4)瑞特氏染色法
方法一：抹片自然干燥，然后在标本上滴加瑞特氏染色液，为了避免很快变干，可稍多加些染色液，或者视情况补充滴加；经1～3分钟，再加约与染液等量的中性蒸馏水或缓冲液，轻轻晃动玻片，使之与染液混匀经5分钟左右，直接用水冲洗(不可先将染液倾去)，吸干或烘干，镜检。细菌染成蓝色，组织、细胞等物呈其它颜色。
方法二：抹片自然干燥，然后按涂抹点大小盖上一块略大的清洁纸片，在其上轻轻滴加染色液，至略浸过滤纸，并看情况补滴，保持不变干，染色3～5分钟；其后直接用水冲洗，吸干或烘干，镜检。此法所用染色液经滤纸过滤，可大大避免沉渣黏附于抹片上而影响镜检观察。
瑞特氏染色液的配制：取瑞特氏染料0．1克置玛瑙乳钵中，徐徐加入甲醇，研磨以促其溶解；将溶液倒人有色中性玻璃瓶，并数次以甲醇洗涤乳钵，亦倒入瓶中，最后使全量为60毫升即可；后置暗处过夜，次日过滤即成。此染色液须置于暗处，其保存期约为数月。
(5)姬姆萨氏染色法
在5毫升新煮过的中性蒸馏水中滴加5～10滴姬姆萨染色液原液，即稀释成为常用的姬姆萨染色液；抹片经甲醇固定并干燥后，在其上滴加足量染色液或将抹片浸入盛有染色液的染色缸中，染色30分钟，或者染色数小时至24小时，取出水洗，吸干或烘干，镜检。细菌呈蓝青色，组织、细胞等呈其它颜色，视野常呈红色。
姬姆萨染色液的配制：取姬姆萨染料0．6克于50毫升的甘油中，置55～60℃水浴中1．5～2小时，然后加入甲醇50毫升，静置1天以上，过滤即成，作为姬姆萨染色液原液贮存。
染色前，于每毫升蒸馏水中加入上述原液1滴，即成姬姆萨氏染色液。应当注意，所用蒸馏水必须为中性或微碱性，若蒸馏水偏酸，可于每10毫升左右的蒸馏水加入1％碳酸钾溶液1滴，使其变成微碱性。
