利用化学药物渗透细菌的体内，使菌体蛋白凝固变性，干忧细菌酶的活性，抑制细菌代谢和生长或损害细胞膜的结构，改变其渗透性，破坏其生理功能等，从而起到消毒灭菌作用。所用的药物称化学消毒剂。有的药物杀灭微生物的能力较强，可以达到灭菌，又称为灭菌剂。
凡不适于物理消毒灭菌而耐潮湿的物品，如锐利的金属、刀、剪、缝针和光学仪器（胃镜、膀胱镜等)及皮肤、粘膜，病人的分泌物、排泄物、病室空气等均可采用此法。
化学消毒灭菌剂的使用原则
（1)根据物品的性能及病原体的特性，选择合适的消毒剂。
（2)严格掌握消毒剂的有效浓度、消毒时间和使用方法。
（3)需消毒的物品应洗净擦干，浸泡时打开轴节，将物品浸没于溶液里。
（4)消毒剂应定期更换，挥发剂应加盖并定期测定比重，及时调整浓度。
（5)浸泡过的物品，使用前需用无菌等渗盐水冲洗，以免消毒剂刺激人体组织。
