业内人士指出，医药流通行业主要有医药调拨(也称批发)、医药纯销(直接对医院销售)和零售(直接针对病患)三种业态模式。而医药销售额80%以上均通过医院实现，因此医院在产业链中具有举足轻重的地位。
南京医药(600713)董秘朱蔚介绍，在目前试点药房托管的医院中，公司已经拿到80%以上的托管权。在实际操作中，公司坚持医院的药品经营性收益占比不变、医院药房人员人均收益不变、药品流通监管主体不变，以及药房人员劳动关系和身份不变。药房托管的医院不再参加以前的药品招标采购，改由托管方统一采购。
按照协议，托管的药房医药商业企业每月将药房利润或者销售收入的一部分(36%-40%不等)上缴医院，保证医院收益不受影响。
目前经营比较好的社会药房，毛利率一般在20-25%，而医院要求40%左右的返点，显然是很高的利润水平。
根据国家有关规定，医院的药品加价率不得超过15%，但在以药养医的生存法则下，医院实际加价率在40%以上甚至高达60%。而这还不包括进入医院的“回扣链”。
业内人士介绍，在患者购买的药品价格中，出厂价约占30%，另有70%则是中间流通环节和医院加价。
行业统计数据显示，近年来国内医药商业企业盈利能力逐年下滑。2005年全行业销售总额保持两位数增长，但是利润却同比下降10.55%，行业整体利润率已经下降到0.57%。
国信证券行业分析师丁丹认为，医药商业的产业地位并没有改变。表面上看，上游厂商的药品进入医院销售必须通过托管的商业企业招标。然而，事实上药房托管之后，处方权仍在医生手中。药房托管带来的变化，只是商业公司拥有了同医院商量用药品种的空间，而不是议价能力，更不是定价权。
医药商业获利空间有何改观？
“对于药房托管这种模式，我们也和北京的医院谈过，好的医院，尤其是三甲医院，根本谈都不愿谈。”国药股份吕致远说，“而一般的医院利润率要求很高，返40%我们算下来是赔本的，所以最后就放弃了。”
南京医药朱蔚则表示，传统的经营模式肯定不能赚钱。南京医药现在的做法是供应链集成化，通过集中采购、集中配送、集中结算来降低成本优化效率，同时和医院的用药需求紧密对接，减少库存。他介绍，原来药房的库存一般在60天以上，而现在可以降低到15天。原来从药厂到医院，中间有6、7个流通环节，而随着统一采购规模的扩大，医药商企可以增强议价能力，减少流通环节，从而降低成本。
统计显示，目前我国医药商业的平均流通费用率为12.56%，而美国医药批发商的流通费用率仅为2.9%。因而医药流通的成本控制还有较大空间。
贺平鸽指出，药房托管可以使医药商业公司的应收账款大为改观。通常医院对商业公司的账款拖欠往往长达半年以上，托管后，现金流就控制在医药商业手中，可以加速资金的周转。
朱蔚介绍，公司应收账款的回款周期一般在30天至60天。
丁丹认为，商业企业除了在规模和份额方面寻求做大外，还可以通过OEM(委托加工贴牌生产)进行高毛利普药品种置换。她指出，医院药房约有20%的普药不是带金销售(回扣)的，医生对这部分药品更换品种不敏感，而商业公司通过OEM销售给医院可以获得较大的盈利空间。
药房托管的推动者强调，医院的收益不会受损失，药房托管挤出的只是医院的不当得利和其他流通环节中的加价。
据南京市卫生局调查，最早一批实行药房托管的南京雨花台中医院，今年1-10月门诊总人次133101人，较2005年同期相比增加了10164人，增加了7.63%。今年1-11月该院业务收入1241万元，同比增加收入94元，增加了8%，其中药品收入662万元，与去年同期持平。
